Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc114Q3UX62 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc114Q3UX62 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc114Q3UX62 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc114Q3UX62 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc114Q3UX62 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc114Q3UX62 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc114Q3UX62 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc114Q3UX62 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc114Q3UX62 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc114Q3UX62 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc114Q3UX62 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc114Q3UX62 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc114Q3UX62 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc114Q3UX62 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc114Q3UX62 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc114Q3UX62 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc114Q3UX62 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc114Q3UX62 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc114Q3UX62 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc114Q3UX62 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc114Q3UX62 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc114Q3UX62 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc114Q3UX62 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc114Q3UX62 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc114Q3UX62 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc114Q3UX62 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc114Q3UX62 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc114Q3UX62 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc114Q3UX62 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc114Q3UX62 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc114Q3UX62 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc114Q3UX62 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc114Q3UX62 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc114Q3UX62 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc114Q3UX62 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc114Q3UX62 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc114Q3UX62 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc114Q3UX62 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc114Q3UX62 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc114Q3UX62 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc114Q3UX62 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc114Q3UX62 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc114Q3UX62 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc114Q3UX62 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc114Q3UX62 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc114Q3UX62 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc114Q3UX62 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc114Q3UX62 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc114Q3UX62 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc114Q3UX62 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc114Q3UX62 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc114Q3UX62 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc114Q3UX62 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc114Q3UX62 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc114Q3UX62 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc114Q3UX62 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc114Q3UX62 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc114Q3UX62 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc114Q3UX62 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc114Q3UX62 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc114Q3UX62 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc114Q3UX62 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc114Q3UX62 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc114Q3UX62 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc114Q3UX62 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc114Q3UX62 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc114Q3UX62 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc114Q3UX62 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc114Q3UX62 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc114Q3UX62 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc114Q3UX62 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc114Q3UX62 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc114Q3UX62 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc114Q3UX62 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc114Q3UX62 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc114Q3UX62 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc114Q3UX62 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc114Q3UX62 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc114Q3UX62 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc114Q3UX62 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc114Q3UX62 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc114Q3UX62 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc114Q3UX62 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc114Q3UX62 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc114Q3UX62 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc114Q3UX62 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc114Q3UX62 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc114Q3UX62 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc114Q3UX62 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc114Q3UX62 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc114Q3UX62 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc114Q3UX62 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc114Q3UX62 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc114Q3UX62 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc114Q3UX62 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc114Q3UX62 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc114Q3UX62 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc114Q3UX62 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc114Q3UX62 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms