Protein–RNA interactions for Protein: Q3USY0

Slc38a11, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 11, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a11Q3USY0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc38a11Q3USY0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc38a11Q3USY0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc38a11Q3USY0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc38a11Q3USY0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Slc38a11Q3USY0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc38a11Q3USY0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc38a11Q3USY0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc38a11Q3USY0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc38a11Q3USY0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc38a11Q3USY0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Slc38a11Q3USY0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc38a11Q3USY0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc38a11Q3USY0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc38a11Q3USY0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Slc38a11Q3USY0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc38a11Q3USY0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc38a11Q3USY0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc38a11Q3USY0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc38a11Q3USY0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc38a11Q3USY0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc38a11Q3USY0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc38a11Q3USY0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc38a11Q3USY0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc38a11Q3USY0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc38a11Q3USY0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc38a11Q3USY0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc38a11Q3USY0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc38a11Q3USY0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc38a11Q3USY0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc38a11Q3USY0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc38a11Q3USY0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc38a11Q3USY0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc38a11Q3USY0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc38a11Q3USY0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc38a11Q3USY0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc38a11Q3USY0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc38a11Q3USY0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc38a11Q3USY0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc38a11Q3USY0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc38a11Q3USY0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc38a11Q3USY0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc38a11Q3USY0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc38a11Q3USY0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc38a11Q3USY0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc38a11Q3USY0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc38a11Q3USY0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc38a11Q3USY0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc38a11Q3USY0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc38a11Q3USY0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc38a11Q3USY0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Slc38a11Q3USY0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc38a11Q3USY0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc38a11Q3USY0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc38a11Q3USY0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc38a11Q3USY0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc38a11Q3USY0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc38a11Q3USY0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc38a11Q3USY0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc38a11Q3USY0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc38a11Q3USY0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc38a11Q3USY0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc38a11Q3USY0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc38a11Q3USY0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc38a11Q3USY0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc38a11Q3USY0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc38a11Q3USY0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc38a11Q3USY0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc38a11Q3USY0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc38a11Q3USY0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc38a11Q3USY0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc38a11Q3USY0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc38a11Q3USY0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc38a11Q3USY0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc38a11Q3USY0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc38a11Q3USY0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc38a11Q3USY0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc38a11Q3USY0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc38a11Q3USY0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc38a11Q3USY0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc38a11Q3USY0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc38a11Q3USY0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc38a11Q3USY0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc38a11Q3USY0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc38a11Q3USY0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc38a11Q3USY0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc38a11Q3USY0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc38a11Q3USY0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc38a11Q3USY0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc38a11Q3USY0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc38a11Q3USY0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc38a11Q3USY0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc38a11Q3USY0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc38a11Q3USY0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc38a11Q3USY0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc38a11Q3USY0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc38a11Q3USY0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc38a11Q3USY0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc38a11Q3USY0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc38a11Q3USY0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms