Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPH1

Prrc1, Protein PRRC1, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc1Q3UPH1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prrc1Q3UPH1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prrc1Q3UPH1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prrc1Q3UPH1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prrc1Q3UPH1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prrc1Q3UPH1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prrc1Q3UPH1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prrc1Q3UPH1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prrc1Q3UPH1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prrc1Q3UPH1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prrc1Q3UPH1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prrc1Q3UPH1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prrc1Q3UPH1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prrc1Q3UPH1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prrc1Q3UPH1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prrc1Q3UPH1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prrc1Q3UPH1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prrc1Q3UPH1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prrc1Q3UPH1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prrc1Q3UPH1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prrc1Q3UPH1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prrc1Q3UPH1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prrc1Q3UPH1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Prrc1Q3UPH1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prrc1Q3UPH1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prrc1Q3UPH1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prrc1Q3UPH1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prrc1Q3UPH1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prrc1Q3UPH1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prrc1Q3UPH1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prrc1Q3UPH1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prrc1Q3UPH1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prrc1Q3UPH1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prrc1Q3UPH1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prrc1Q3UPH1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prrc1Q3UPH1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prrc1Q3UPH1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prrc1Q3UPH1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prrc1Q3UPH1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prrc1Q3UPH1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prrc1Q3UPH1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prrc1Q3UPH1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prrc1Q3UPH1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prrc1Q3UPH1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prrc1Q3UPH1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prrc1Q3UPH1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prrc1Q3UPH1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prrc1Q3UPH1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Prrc1Q3UPH1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Prrc1Q3UPH1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prrc1Q3UPH1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Prrc1Q3UPH1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prrc1Q3UPH1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prrc1Q3UPH1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prrc1Q3UPH1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prrc1Q3UPH1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Prrc1Q3UPH1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prrc1Q3UPH1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prrc1Q3UPH1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prrc1Q3UPH1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prrc1Q3UPH1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prrc1Q3UPH1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prrc1Q3UPH1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prrc1Q3UPH1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prrc1Q3UPH1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prrc1Q3UPH1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prrc1Q3UPH1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prrc1Q3UPH1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prrc1Q3UPH1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prrc1Q3UPH1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prrc1Q3UPH1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prrc1Q3UPH1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prrc1Q3UPH1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prrc1Q3UPH1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prrc1Q3UPH1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prrc1Q3UPH1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prrc1Q3UPH1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prrc1Q3UPH1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prrc1Q3UPH1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prrc1Q3UPH1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prrc1Q3UPH1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prrc1Q3UPH1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prrc1Q3UPH1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prrc1Q3UPH1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prrc1Q3UPH1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prrc1Q3UPH1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prrc1Q3UPH1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prrc1Q3UPH1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prrc1Q3UPH1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prrc1Q3UPH1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prrc1Q3UPH1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prrc1Q3UPH1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prrc1Q3UPH1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prrc1Q3UPH1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prrc1Q3UPH1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prrc1Q3UPH1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prrc1Q3UPH1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prrc1Q3UPH1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prrc1Q3UPH1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prrc1Q3UPH1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 170.3 ms