Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNW5

Tfcp2l1, Transcription factor CP2-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfcp2l1Q3UNW5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Tfcp2l1Q3UNW5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tfcp2l1Q3UNW5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tfcp2l1Q3UNW5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tfcp2l1Q3UNW5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tfcp2l1Q3UNW5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tfcp2l1Q3UNW5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tfcp2l1Q3UNW5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tfcp2l1Q3UNW5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tfcp2l1Q3UNW5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tfcp2l1Q3UNW5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tfcp2l1Q3UNW5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tfcp2l1Q3UNW5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tfcp2l1Q3UNW5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tfcp2l1Q3UNW5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tfcp2l1Q3UNW5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tfcp2l1Q3UNW5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tfcp2l1Q3UNW5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tfcp2l1Q3UNW5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tfcp2l1Q3UNW5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tfcp2l1Q3UNW5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tfcp2l1Q3UNW5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Tfcp2l1Q3UNW5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Tfcp2l1Q3UNW5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tfcp2l1Q3UNW5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tfcp2l1Q3UNW5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tfcp2l1Q3UNW5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tfcp2l1Q3UNW5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tfcp2l1Q3UNW5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tfcp2l1Q3UNW5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tfcp2l1Q3UNW5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tfcp2l1Q3UNW5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tfcp2l1Q3UNW5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tfcp2l1Q3UNW5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tfcp2l1Q3UNW5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tfcp2l1Q3UNW5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tfcp2l1Q3UNW5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tfcp2l1Q3UNW5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tfcp2l1Q3UNW5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tfcp2l1Q3UNW5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tfcp2l1Q3UNW5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tfcp2l1Q3UNW5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tfcp2l1Q3UNW5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tfcp2l1Q3UNW5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tfcp2l1Q3UNW5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tfcp2l1Q3UNW5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tfcp2l1Q3UNW5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tfcp2l1Q3UNW5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tfcp2l1Q3UNW5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tfcp2l1Q3UNW5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Tfcp2l1Q3UNW5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tfcp2l1Q3UNW5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tfcp2l1Q3UNW5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tfcp2l1Q3UNW5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tfcp2l1Q3UNW5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tfcp2l1Q3UNW5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tfcp2l1Q3UNW5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tfcp2l1Q3UNW5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tfcp2l1Q3UNW5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tfcp2l1Q3UNW5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tfcp2l1Q3UNW5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Tfcp2l1Q3UNW5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tfcp2l1Q3UNW5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Tfcp2l1Q3UNW5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tfcp2l1Q3UNW5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tfcp2l1Q3UNW5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tfcp2l1Q3UNW5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tfcp2l1Q3UNW5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tfcp2l1Q3UNW5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tfcp2l1Q3UNW5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tfcp2l1Q3UNW5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tfcp2l1Q3UNW5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tfcp2l1Q3UNW5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tfcp2l1Q3UNW5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Tfcp2l1Q3UNW5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tfcp2l1Q3UNW5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tfcp2l1Q3UNW5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tfcp2l1Q3UNW5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tfcp2l1Q3UNW5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tfcp2l1Q3UNW5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tfcp2l1Q3UNW5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tfcp2l1Q3UNW5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tfcp2l1Q3UNW5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tfcp2l1Q3UNW5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tfcp2l1Q3UNW5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tfcp2l1Q3UNW5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tfcp2l1Q3UNW5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Tfcp2l1Q3UNW5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms