Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CrxosQ3UL53 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CrxosQ3UL53 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CrxosQ3UL53 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CrxosQ3UL53 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CrxosQ3UL53 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CrxosQ3UL53 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CrxosQ3UL53 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CrxosQ3UL53 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CrxosQ3UL53 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CrxosQ3UL53 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CrxosQ3UL53 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CrxosQ3UL53 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CrxosQ3UL53 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CrxosQ3UL53 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CrxosQ3UL53 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
CrxosQ3UL53 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CrxosQ3UL53 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CrxosQ3UL53 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CrxosQ3UL53 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CrxosQ3UL53 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CrxosQ3UL53 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CrxosQ3UL53 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CrxosQ3UL53 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CrxosQ3UL53 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CrxosQ3UL53 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CrxosQ3UL53 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CrxosQ3UL53 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CrxosQ3UL53 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CrxosQ3UL53 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CrxosQ3UL53 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CrxosQ3UL53 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CrxosQ3UL53 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CrxosQ3UL53 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CrxosQ3UL53 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CrxosQ3UL53 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CrxosQ3UL53 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CrxosQ3UL53 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CrxosQ3UL53 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CrxosQ3UL53 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CrxosQ3UL53 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CrxosQ3UL53 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CrxosQ3UL53 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CrxosQ3UL53 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CrxosQ3UL53 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CrxosQ3UL53 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CrxosQ3UL53 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CrxosQ3UL53 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CrxosQ3UL53 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CrxosQ3UL53 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CrxosQ3UL53 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CrxosQ3UL53 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CrxosQ3UL53 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CrxosQ3UL53 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CrxosQ3UL53 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CrxosQ3UL53 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CrxosQ3UL53 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CrxosQ3UL53 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CrxosQ3UL53 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CrxosQ3UL53 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CrxosQ3UL53 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CrxosQ3UL53 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CrxosQ3UL53 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CrxosQ3UL53 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CrxosQ3UL53 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CrxosQ3UL53 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CrxosQ3UL53 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CrxosQ3UL53 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CrxosQ3UL53 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CrxosQ3UL53 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CrxosQ3UL53 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CrxosQ3UL53 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CrxosQ3UL53 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CrxosQ3UL53 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CrxosQ3UL53 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CrxosQ3UL53 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CrxosQ3UL53 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CrxosQ3UL53 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CrxosQ3UL53 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CrxosQ3UL53 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CrxosQ3UL53 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CrxosQ3UL53 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CrxosQ3UL53 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CrxosQ3UL53 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CrxosQ3UL53 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CrxosQ3UL53 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CrxosQ3UL53 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CrxosQ3UL53 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CrxosQ3UL53 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CrxosQ3UL53 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CrxosQ3UL53 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CrxosQ3UL53 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CrxosQ3UL53 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CrxosQ3UL53 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CrxosQ3UL53 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CrxosQ3UL53 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CrxosQ3UL53 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CrxosQ3UL53 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CrxosQ3UL53 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CrxosQ3UL53 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms