Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKP4

Ceacam12, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 12, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ceacam12Q3UKP4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ceacam12Q3UKP4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ceacam12Q3UKP4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ceacam12Q3UKP4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ceacam12Q3UKP4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ceacam12Q3UKP4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ceacam12Q3UKP4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ceacam12Q3UKP4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ceacam12Q3UKP4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ceacam12Q3UKP4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ceacam12Q3UKP4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ceacam12Q3UKP4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ceacam12Q3UKP4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ceacam12Q3UKP4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ceacam12Q3UKP4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ceacam12Q3UKP4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ceacam12Q3UKP4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ceacam12Q3UKP4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ceacam12Q3UKP4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ceacam12Q3UKP4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ceacam12Q3UKP4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ceacam12Q3UKP4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ceacam12Q3UKP4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ceacam12Q3UKP4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ceacam12Q3UKP4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ceacam12Q3UKP4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ceacam12Q3UKP4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ceacam12Q3UKP4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ceacam12Q3UKP4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ceacam12Q3UKP4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ceacam12Q3UKP4 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ceacam12Q3UKP4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ceacam12Q3UKP4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ceacam12Q3UKP4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ceacam12Q3UKP4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ceacam12Q3UKP4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ceacam12Q3UKP4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ceacam12Q3UKP4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ceacam12Q3UKP4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ceacam12Q3UKP4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ceacam12Q3UKP4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ceacam12Q3UKP4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ceacam12Q3UKP4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ceacam12Q3UKP4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ceacam12Q3UKP4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ceacam12Q3UKP4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ceacam12Q3UKP4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ceacam12Q3UKP4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ceacam12Q3UKP4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ceacam12Q3UKP4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ceacam12Q3UKP4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Ceacam12Q3UKP4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ceacam12Q3UKP4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ceacam12Q3UKP4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ceacam12Q3UKP4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ceacam12Q3UKP4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ceacam12Q3UKP4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ceacam12Q3UKP4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ceacam12Q3UKP4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ceacam12Q3UKP4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ceacam12Q3UKP4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ceacam12Q3UKP4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ceacam12Q3UKP4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ceacam12Q3UKP4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ceacam12Q3UKP4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ceacam12Q3UKP4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ceacam12Q3UKP4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ceacam12Q3UKP4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ceacam12Q3UKP4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ceacam12Q3UKP4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ceacam12Q3UKP4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ceacam12Q3UKP4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ceacam12Q3UKP4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ceacam12Q3UKP4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ceacam12Q3UKP4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ceacam12Q3UKP4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ceacam12Q3UKP4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ceacam12Q3UKP4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ceacam12Q3UKP4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ceacam12Q3UKP4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ceacam12Q3UKP4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ceacam12Q3UKP4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ceacam12Q3UKP4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ceacam12Q3UKP4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ceacam12Q3UKP4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ceacam12Q3UKP4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ceacam12Q3UKP4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ceacam12Q3UKP4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ceacam12Q3UKP4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ceacam12Q3UKP4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ceacam12Q3UKP4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ceacam12Q3UKP4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ceacam12Q3UKP4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ceacam12Q3UKP4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ceacam12Q3UKP4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ceacam12Q3UKP4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ceacam12Q3UKP4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ceacam12Q3UKP4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ceacam12Q3UKP4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ceacam12Q3UKP4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.5 ms