Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKK2

Ceacam5, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 5, mousemouse

Predictions only

Length 947 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ceacam5Q3UKK2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ceacam5Q3UKK2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ceacam5Q3UKK2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ceacam5Q3UKK2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ceacam5Q3UKK2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ceacam5Q3UKK2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ceacam5Q3UKK2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ceacam5Q3UKK2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ceacam5Q3UKK2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ceacam5Q3UKK2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ceacam5Q3UKK2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ceacam5Q3UKK2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ceacam5Q3UKK2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ceacam5Q3UKK2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ceacam5Q3UKK2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ceacam5Q3UKK2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ceacam5Q3UKK2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ceacam5Q3UKK2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ceacam5Q3UKK2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ceacam5Q3UKK2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ceacam5Q3UKK2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ceacam5Q3UKK2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ceacam5Q3UKK2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ceacam5Q3UKK2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ceacam5Q3UKK2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ceacam5Q3UKK2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ceacam5Q3UKK2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ceacam5Q3UKK2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ceacam5Q3UKK2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ceacam5Q3UKK2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ceacam5Q3UKK2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ceacam5Q3UKK2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ceacam5Q3UKK2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ceacam5Q3UKK2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ceacam5Q3UKK2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ceacam5Q3UKK2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ceacam5Q3UKK2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ceacam5Q3UKK2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ceacam5Q3UKK2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ceacam5Q3UKK2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ceacam5Q3UKK2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ceacam5Q3UKK2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ceacam5Q3UKK2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ceacam5Q3UKK2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ceacam5Q3UKK2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ceacam5Q3UKK2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ceacam5Q3UKK2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ceacam5Q3UKK2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ceacam5Q3UKK2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ceacam5Q3UKK2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ceacam5Q3UKK2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ceacam5Q3UKK2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ceacam5Q3UKK2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ceacam5Q3UKK2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ceacam5Q3UKK2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ceacam5Q3UKK2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ceacam5Q3UKK2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ceacam5Q3UKK2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ceacam5Q3UKK2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Ceacam5Q3UKK2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ceacam5Q3UKK2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ceacam5Q3UKK2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ceacam5Q3UKK2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ceacam5Q3UKK2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ceacam5Q3UKK2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ceacam5Q3UKK2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ceacam5Q3UKK2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ceacam5Q3UKK2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ceacam5Q3UKK2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ceacam5Q3UKK2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ceacam5Q3UKK2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ceacam5Q3UKK2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ceacam5Q3UKK2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ceacam5Q3UKK2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ceacam5Q3UKK2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ceacam5Q3UKK2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ceacam5Q3UKK2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ceacam5Q3UKK2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ceacam5Q3UKK2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ceacam5Q3UKK2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ceacam5Q3UKK2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ceacam5Q3UKK2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ceacam5Q3UKK2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ceacam5Q3UKK2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ceacam5Q3UKK2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ceacam5Q3UKK2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ceacam5Q3UKK2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ceacam5Q3UKK2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ceacam5Q3UKK2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ceacam5Q3UKK2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ceacam5Q3UKK2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ceacam5Q3UKK2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ceacam5Q3UKK2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ceacam5Q3UKK2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ceacam5Q3UKK2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ceacam5Q3UKK2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ceacam5Q3UKK2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ceacam5Q3UKK2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ceacam5Q3UKK2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ceacam5Q3UKK2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms