Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB9

Edc4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edc4Q3UJB9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Edc4Q3UJB9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Edc4Q3UJB9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Edc4Q3UJB9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Edc4Q3UJB9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Edc4Q3UJB9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Edc4Q3UJB9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Edc4Q3UJB9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Edc4Q3UJB9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Edc4Q3UJB9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Edc4Q3UJB9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Edc4Q3UJB9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Edc4Q3UJB9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Edc4Q3UJB9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Edc4Q3UJB9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Edc4Q3UJB9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Edc4Q3UJB9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Edc4Q3UJB9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Edc4Q3UJB9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Edc4Q3UJB9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Edc4Q3UJB9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Edc4Q3UJB9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Edc4Q3UJB9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Edc4Q3UJB9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Edc4Q3UJB9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Edc4Q3UJB9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Edc4Q3UJB9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Edc4Q3UJB9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Edc4Q3UJB9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Edc4Q3UJB9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Edc4Q3UJB9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Edc4Q3UJB9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Edc4Q3UJB9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Edc4Q3UJB9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Edc4Q3UJB9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Edc4Q3UJB9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Edc4Q3UJB9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Edc4Q3UJB9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Edc4Q3UJB9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Edc4Q3UJB9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Edc4Q3UJB9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Edc4Q3UJB9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.46
Edc4Q3UJB9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC30.45■■■□□ 2.46
Edc4Q3UJB9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC30.45■■■□□ 2.46
Edc4Q3UJB9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Edc4Q3UJB9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
Edc4Q3UJB9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Edc4Q3UJB9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Edc4Q3UJB9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Edc4Q3UJB9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Edc4Q3UJB9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Edc4Q3UJB9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Edc4Q3UJB9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Edc4Q3UJB9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Edc4Q3UJB9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Edc4Q3UJB9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Edc4Q3UJB9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Edc4Q3UJB9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Edc4Q3UJB9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Edc4Q3UJB9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Edc4Q3UJB9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Edc4Q3UJB9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Edc4Q3UJB9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Edc4Q3UJB9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Edc4Q3UJB9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Edc4Q3UJB9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Edc4Q3UJB9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Edc4Q3UJB9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Edc4Q3UJB9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Edc4Q3UJB9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
Edc4Q3UJB9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Edc4Q3UJB9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Edc4Q3UJB9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Edc4Q3UJB9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Edc4Q3UJB9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Edc4Q3UJB9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Edc4Q3UJB9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Edc4Q3UJB9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Edc4Q3UJB9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
Edc4Q3UJB9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
Edc4Q3UJB9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Edc4Q3UJB9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Edc4Q3UJB9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Edc4Q3UJB9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Edc4Q3UJB9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.45
Edc4Q3UJB9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC30.39■■■□□ 2.45
Edc4Q3UJB9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Edc4Q3UJB9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Edc4Q3UJB9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Edc4Q3UJB9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Edc4Q3UJB9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Edc4Q3UJB9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Edc4Q3UJB9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Edc4Q3UJB9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Edc4Q3UJB9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Edc4Q3UJB9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Edc4Q3UJB9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Edc4Q3UJB9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Edc4Q3UJB9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Edc4Q3UJB9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms