Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Sf3b2Q3UJB0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Sf3b2Q3UJB0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sf3b2Q3UJB0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sf3b2Q3UJB0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sf3b2Q3UJB0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sf3b2Q3UJB0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sf3b2Q3UJB0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Sf3b2Q3UJB0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Sf3b2Q3UJB0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Sf3b2Q3UJB0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Sf3b2Q3UJB0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sf3b2Q3UJB0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sf3b2Q3UJB0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sf3b2Q3UJB0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sf3b2Q3UJB0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sf3b2Q3UJB0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sf3b2Q3UJB0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Sf3b2Q3UJB0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Sf3b2Q3UJB0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Sf3b2Q3UJB0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Sf3b2Q3UJB0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Sf3b2Q3UJB0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sf3b2Q3UJB0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sf3b2Q3UJB0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sf3b2Q3UJB0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sf3b2Q3UJB0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sf3b2Q3UJB0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sf3b2Q3UJB0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sf3b2Q3UJB0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sf3b2Q3UJB0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Sf3b2Q3UJB0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sf3b2Q3UJB0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sf3b2Q3UJB0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sf3b2Q3UJB0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sf3b2Q3UJB0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sf3b2Q3UJB0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sf3b2Q3UJB0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Sf3b2Q3UJB0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sf3b2Q3UJB0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sf3b2Q3UJB0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sf3b2Q3UJB0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sf3b2Q3UJB0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sf3b2Q3UJB0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sf3b2Q3UJB0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sf3b2Q3UJB0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Sf3b2Q3UJB0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Sf3b2Q3UJB0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Sf3b2Q3UJB0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Sf3b2Q3UJB0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Sf3b2Q3UJB0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Sf3b2Q3UJB0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Sf3b2Q3UJB0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sf3b2Q3UJB0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sf3b2Q3UJB0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sf3b2Q3UJB0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sf3b2Q3UJB0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sf3b2Q3UJB0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Sf3b2Q3UJB0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sf3b2Q3UJB0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sf3b2Q3UJB0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Sf3b2Q3UJB0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Sf3b2Q3UJB0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Sf3b2Q3UJB0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Sf3b2Q3UJB0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Sf3b2Q3UJB0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Sf3b2Q3UJB0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Sf3b2Q3UJB0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sf3b2Q3UJB0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sf3b2Q3UJB0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sf3b2Q3UJB0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sf3b2Q3UJB0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sf3b2Q3UJB0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sf3b2Q3UJB0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sf3b2Q3UJB0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sf3b2Q3UJB0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sf3b2Q3UJB0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sf3b2Q3UJB0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sf3b2Q3UJB0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sf3b2Q3UJB0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sf3b2Q3UJB0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sf3b2Q3UJB0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Sf3b2Q3UJB0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Sf3b2Q3UJB0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Sf3b2Q3UJB0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Sf3b2Q3UJB0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sf3b2Q3UJB0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sf3b2Q3UJB0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sf3b2Q3UJB0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sf3b2Q3UJB0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sf3b2Q3UJB0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sf3b2Q3UJB0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sf3b2Q3UJB0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sf3b2Q3UJB0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sf3b2Q3UJB0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sf3b2Q3UJB0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sf3b2Q3UJB0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sf3b2Q3UJB0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sf3b2Q3UJB0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms