Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHK3

Greb1, Protein GREB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,954 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Greb1Q3UHK3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Greb1Q3UHK3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Greb1Q3UHK3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Greb1Q3UHK3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Greb1Q3UHK3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Greb1Q3UHK3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Greb1Q3UHK3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Greb1Q3UHK3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Greb1Q3UHK3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Greb1Q3UHK3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Greb1Q3UHK3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Greb1Q3UHK3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Greb1Q3UHK3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Greb1Q3UHK3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Greb1Q3UHK3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Greb1Q3UHK3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Greb1Q3UHK3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Greb1Q3UHK3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Greb1Q3UHK3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Greb1Q3UHK3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Greb1Q3UHK3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Greb1Q3UHK3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Greb1Q3UHK3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Greb1Q3UHK3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Greb1Q3UHK3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Greb1Q3UHK3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Greb1Q3UHK3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Greb1Q3UHK3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Greb1Q3UHK3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Greb1Q3UHK3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Greb1Q3UHK3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Greb1Q3UHK3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Greb1Q3UHK3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Greb1Q3UHK3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Greb1Q3UHK3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Greb1Q3UHK3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Greb1Q3UHK3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Greb1Q3UHK3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Greb1Q3UHK3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Greb1Q3UHK3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Greb1Q3UHK3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Greb1Q3UHK3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Greb1Q3UHK3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Greb1Q3UHK3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Greb1Q3UHK3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Greb1Q3UHK3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Greb1Q3UHK3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Greb1Q3UHK3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Greb1Q3UHK3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Greb1Q3UHK3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Greb1Q3UHK3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Greb1Q3UHK3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Greb1Q3UHK3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Greb1Q3UHK3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Greb1Q3UHK3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Greb1Q3UHK3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Greb1Q3UHK3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Greb1Q3UHK3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Greb1Q3UHK3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Greb1Q3UHK3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Greb1Q3UHK3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Greb1Q3UHK3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Greb1Q3UHK3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Greb1Q3UHK3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Greb1Q3UHK3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Greb1Q3UHK3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Greb1Q3UHK3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Greb1Q3UHK3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Greb1Q3UHK3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Greb1Q3UHK3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Greb1Q3UHK3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Greb1Q3UHK3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Greb1Q3UHK3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Greb1Q3UHK3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Greb1Q3UHK3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Greb1Q3UHK3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Greb1Q3UHK3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Greb1Q3UHK3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Greb1Q3UHK3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Greb1Q3UHK3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Greb1Q3UHK3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Greb1Q3UHK3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Greb1Q3UHK3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Greb1Q3UHK3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Greb1Q3UHK3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Greb1Q3UHK3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Greb1Q3UHK3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Greb1Q3UHK3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Greb1Q3UHK3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Greb1Q3UHK3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Greb1Q3UHK3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Greb1Q3UHK3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Greb1Q3UHK3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Greb1Q3UHK3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Greb1Q3UHK3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Greb1Q3UHK3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Greb1Q3UHK3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Greb1Q3UHK3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Greb1Q3UHK3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Greb1Q3UHK3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms