Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHG7

Lchn, Protein LCHN, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LchnQ3UHG7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LchnQ3UHG7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LchnQ3UHG7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LchnQ3UHG7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LchnQ3UHG7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LchnQ3UHG7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LchnQ3UHG7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LchnQ3UHG7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LchnQ3UHG7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LchnQ3UHG7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LchnQ3UHG7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LchnQ3UHG7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LchnQ3UHG7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LchnQ3UHG7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LchnQ3UHG7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LchnQ3UHG7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LchnQ3UHG7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LchnQ3UHG7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LchnQ3UHG7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LchnQ3UHG7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LchnQ3UHG7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LchnQ3UHG7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LchnQ3UHG7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LchnQ3UHG7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LchnQ3UHG7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LchnQ3UHG7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LchnQ3UHG7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LchnQ3UHG7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LchnQ3UHG7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LchnQ3UHG7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LchnQ3UHG7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LchnQ3UHG7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LchnQ3UHG7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LchnQ3UHG7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LchnQ3UHG7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LchnQ3UHG7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LchnQ3UHG7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LchnQ3UHG7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.33■■□□□ 1
LchnQ3UHG7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LchnQ3UHG7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LchnQ3UHG7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LchnQ3UHG7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LchnQ3UHG7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LchnQ3UHG7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LchnQ3UHG7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LchnQ3UHG7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LchnQ3UHG7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LchnQ3UHG7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LchnQ3UHG7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LchnQ3UHG7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LchnQ3UHG7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LchnQ3UHG7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LchnQ3UHG7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LchnQ3UHG7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LchnQ3UHG7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LchnQ3UHG7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LchnQ3UHG7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LchnQ3UHG7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LchnQ3UHG7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LchnQ3UHG7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
LchnQ3UHG7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LchnQ3UHG7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LchnQ3UHG7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LchnQ3UHG7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LchnQ3UHG7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LchnQ3UHG7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LchnQ3UHG7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LchnQ3UHG7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
LchnQ3UHG7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
LchnQ3UHG7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LchnQ3UHG7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LchnQ3UHG7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LchnQ3UHG7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LchnQ3UHG7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LchnQ3UHG7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LchnQ3UHG7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LchnQ3UHG7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
LchnQ3UHG7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LchnQ3UHG7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LchnQ3UHG7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LchnQ3UHG7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LchnQ3UHG7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LchnQ3UHG7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LchnQ3UHG7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LchnQ3UHG7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LchnQ3UHG7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LchnQ3UHG7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LchnQ3UHG7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LchnQ3UHG7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LchnQ3UHG7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LchnQ3UHG7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LchnQ3UHG7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LchnQ3UHG7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LchnQ3UHG7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LchnQ3UHG7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LchnQ3UHG7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LchnQ3UHG7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LchnQ3UHG7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LchnQ3UHG7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LchnQ3UHG7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms