Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGY8

Arfgef3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef3Q3UGY8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Arfgef3Q3UGY8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Arfgef3Q3UGY8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Arfgef3Q3UGY8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Arfgef3Q3UGY8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Arfgef3Q3UGY8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Arfgef3Q3UGY8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Arfgef3Q3UGY8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Arfgef3Q3UGY8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Arfgef3Q3UGY8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Arfgef3Q3UGY8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Arfgef3Q3UGY8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Arfgef3Q3UGY8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Arfgef3Q3UGY8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Arfgef3Q3UGY8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Arfgef3Q3UGY8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Arfgef3Q3UGY8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Arfgef3Q3UGY8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Arfgef3Q3UGY8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Arfgef3Q3UGY8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Arfgef3Q3UGY8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Arfgef3Q3UGY8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Arfgef3Q3UGY8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Arfgef3Q3UGY8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Arfgef3Q3UGY8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Arfgef3Q3UGY8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Arfgef3Q3UGY8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Arfgef3Q3UGY8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Arfgef3Q3UGY8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Arfgef3Q3UGY8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Arfgef3Q3UGY8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Arfgef3Q3UGY8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Arfgef3Q3UGY8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Arfgef3Q3UGY8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Arfgef3Q3UGY8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Arfgef3Q3UGY8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Arfgef3Q3UGY8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Arfgef3Q3UGY8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Arfgef3Q3UGY8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Arfgef3Q3UGY8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Arfgef3Q3UGY8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Arfgef3Q3UGY8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Arfgef3Q3UGY8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Arfgef3Q3UGY8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Arfgef3Q3UGY8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Arfgef3Q3UGY8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Arfgef3Q3UGY8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Arfgef3Q3UGY8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Arfgef3Q3UGY8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Arfgef3Q3UGY8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Arfgef3Q3UGY8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Arfgef3Q3UGY8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Arfgef3Q3UGY8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Arfgef3Q3UGY8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Arfgef3Q3UGY8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Arfgef3Q3UGY8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Arfgef3Q3UGY8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Arfgef3Q3UGY8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Arfgef3Q3UGY8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Arfgef3Q3UGY8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Arfgef3Q3UGY8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Arfgef3Q3UGY8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Arfgef3Q3UGY8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Arfgef3Q3UGY8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Arfgef3Q3UGY8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Arfgef3Q3UGY8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Arfgef3Q3UGY8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Arfgef3Q3UGY8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Arfgef3Q3UGY8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Arfgef3Q3UGY8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Arfgef3Q3UGY8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Arfgef3Q3UGY8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Arfgef3Q3UGY8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Arfgef3Q3UGY8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Arfgef3Q3UGY8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Arfgef3Q3UGY8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Arfgef3Q3UGY8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Arfgef3Q3UGY8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Arfgef3Q3UGY8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Arfgef3Q3UGY8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Arfgef3Q3UGY8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Arfgef3Q3UGY8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Arfgef3Q3UGY8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Arfgef3Q3UGY8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Arfgef3Q3UGY8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Arfgef3Q3UGY8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Arfgef3Q3UGY8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Arfgef3Q3UGY8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Arfgef3Q3UGY8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Arfgef3Q3UGY8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Arfgef3Q3UGY8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Arfgef3Q3UGY8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Arfgef3Q3UGY8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Arfgef3Q3UGY8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Arfgef3Q3UGY8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Arfgef3Q3UGY8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Arfgef3Q3UGY8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Arfgef3Q3UGY8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Arfgef3Q3UGY8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Arfgef3Q3UGY8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms