Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFM5

Nom1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nom1Q3UFM5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Nom1Q3UFM5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nom1Q3UFM5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nom1Q3UFM5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nom1Q3UFM5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nom1Q3UFM5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nom1Q3UFM5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nom1Q3UFM5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nom1Q3UFM5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nom1Q3UFM5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nom1Q3UFM5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nom1Q3UFM5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nom1Q3UFM5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nom1Q3UFM5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nom1Q3UFM5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nom1Q3UFM5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nom1Q3UFM5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nom1Q3UFM5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nom1Q3UFM5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Nom1Q3UFM5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nom1Q3UFM5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nom1Q3UFM5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nom1Q3UFM5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Nom1Q3UFM5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nom1Q3UFM5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nom1Q3UFM5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nom1Q3UFM5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nom1Q3UFM5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nom1Q3UFM5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nom1Q3UFM5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Nom1Q3UFM5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nom1Q3UFM5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nom1Q3UFM5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nom1Q3UFM5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nom1Q3UFM5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nom1Q3UFM5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nom1Q3UFM5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nom1Q3UFM5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nom1Q3UFM5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nom1Q3UFM5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nom1Q3UFM5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nom1Q3UFM5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nom1Q3UFM5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nom1Q3UFM5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nom1Q3UFM5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nom1Q3UFM5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nom1Q3UFM5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nom1Q3UFM5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nom1Q3UFM5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nom1Q3UFM5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nom1Q3UFM5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nom1Q3UFM5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nom1Q3UFM5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nom1Q3UFM5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nom1Q3UFM5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nom1Q3UFM5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nom1Q3UFM5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nom1Q3UFM5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nom1Q3UFM5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nom1Q3UFM5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nom1Q3UFM5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nom1Q3UFM5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nom1Q3UFM5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nom1Q3UFM5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nom1Q3UFM5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nom1Q3UFM5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nom1Q3UFM5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nom1Q3UFM5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Nom1Q3UFM5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nom1Q3UFM5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nom1Q3UFM5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nom1Q3UFM5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nom1Q3UFM5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nom1Q3UFM5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nom1Q3UFM5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nom1Q3UFM5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nom1Q3UFM5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Nom1Q3UFM5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nom1Q3UFM5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nom1Q3UFM5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nom1Q3UFM5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nom1Q3UFM5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nom1Q3UFM5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nom1Q3UFM5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nom1Q3UFM5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nom1Q3UFM5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nom1Q3UFM5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nom1Q3UFM5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Nom1Q3UFM5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nom1Q3UFM5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nom1Q3UFM5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nom1Q3UFM5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nom1Q3UFM5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nom1Q3UFM5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nom1Q3UFM5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nom1Q3UFM5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nom1Q3UFM5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nom1Q3UFM5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Nom1Q3UFM5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nom1Q3UFM5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms