Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Puf60Q3UEB3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Puf60Q3UEB3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Puf60Q3UEB3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Puf60Q3UEB3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Puf60Q3UEB3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Puf60Q3UEB3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Puf60Q3UEB3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Puf60Q3UEB3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Puf60Q3UEB3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Puf60Q3UEB3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Puf60Q3UEB3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Puf60Q3UEB3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Puf60Q3UEB3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Puf60Q3UEB3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Puf60Q3UEB3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Puf60Q3UEB3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Puf60Q3UEB3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Puf60Q3UEB3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Puf60Q3UEB3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Puf60Q3UEB3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Puf60Q3UEB3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Puf60Q3UEB3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Puf60Q3UEB3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Puf60Q3UEB3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Puf60Q3UEB3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Puf60Q3UEB3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Puf60Q3UEB3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Puf60Q3UEB3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Puf60Q3UEB3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Puf60Q3UEB3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Puf60Q3UEB3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Puf60Q3UEB3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Puf60Q3UEB3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Puf60Q3UEB3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Puf60Q3UEB3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Puf60Q3UEB3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Puf60Q3UEB3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Puf60Q3UEB3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Puf60Q3UEB3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Puf60Q3UEB3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Puf60Q3UEB3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Puf60Q3UEB3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Puf60Q3UEB3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Puf60Q3UEB3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Puf60Q3UEB3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Puf60Q3UEB3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Puf60Q3UEB3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Puf60Q3UEB3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Puf60Q3UEB3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Puf60Q3UEB3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Puf60Q3UEB3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Puf60Q3UEB3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Puf60Q3UEB3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Puf60Q3UEB3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Puf60Q3UEB3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Puf60Q3UEB3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Puf60Q3UEB3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Puf60Q3UEB3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Puf60Q3UEB3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Puf60Q3UEB3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Puf60Q3UEB3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Puf60Q3UEB3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Puf60Q3UEB3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Puf60Q3UEB3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Puf60Q3UEB3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Puf60Q3UEB3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Puf60Q3UEB3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Puf60Q3UEB3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Puf60Q3UEB3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Puf60Q3UEB3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Puf60Q3UEB3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Puf60Q3UEB3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Puf60Q3UEB3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Puf60Q3UEB3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Puf60Q3UEB3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Puf60Q3UEB3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Puf60Q3UEB3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Puf60Q3UEB3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Puf60Q3UEB3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Puf60Q3UEB3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Puf60Q3UEB3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Puf60Q3UEB3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Puf60Q3UEB3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Puf60Q3UEB3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Puf60Q3UEB3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Puf60Q3UEB3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Puf60Q3UEB3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Puf60Q3UEB3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Puf60Q3UEB3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Puf60Q3UEB3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Puf60Q3UEB3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Puf60Q3UEB3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Puf60Q3UEB3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Puf60Q3UEB3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Puf60Q3UEB3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Puf60Q3UEB3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Puf60Q3UEB3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Puf60Q3UEB3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Puf60Q3UEB3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.7 ms