Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9F6

Rnf166, RING finger protein 166, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf166Q3U9F6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rnf166Q3U9F6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Rnf166Q3U9F6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rnf166Q3U9F6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rnf166Q3U9F6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rnf166Q3U9F6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rnf166Q3U9F6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rnf166Q3U9F6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Rnf166Q3U9F6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rnf166Q3U9F6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rnf166Q3U9F6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rnf166Q3U9F6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rnf166Q3U9F6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rnf166Q3U9F6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rnf166Q3U9F6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rnf166Q3U9F6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rnf166Q3U9F6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rnf166Q3U9F6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Rnf166Q3U9F6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rnf166Q3U9F6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rnf166Q3U9F6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rnf166Q3U9F6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rnf166Q3U9F6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rnf166Q3U9F6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rnf166Q3U9F6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rnf166Q3U9F6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rnf166Q3U9F6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rnf166Q3U9F6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rnf166Q3U9F6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rnf166Q3U9F6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rnf166Q3U9F6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rnf166Q3U9F6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf166Q3U9F6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf166Q3U9F6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf166Q3U9F6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf166Q3U9F6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf166Q3U9F6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf166Q3U9F6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf166Q3U9F6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf166Q3U9F6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf166Q3U9F6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf166Q3U9F6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf166Q3U9F6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf166Q3U9F6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf166Q3U9F6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf166Q3U9F6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf166Q3U9F6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf166Q3U9F6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf166Q3U9F6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf166Q3U9F6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf166Q3U9F6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf166Q3U9F6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rnf166Q3U9F6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rnf166Q3U9F6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rnf166Q3U9F6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rnf166Q3U9F6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnf166Q3U9F6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnf166Q3U9F6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnf166Q3U9F6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf166Q3U9F6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf166Q3U9F6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf166Q3U9F6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf166Q3U9F6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf166Q3U9F6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf166Q3U9F6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf166Q3U9F6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf166Q3U9F6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf166Q3U9F6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf166Q3U9F6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf166Q3U9F6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf166Q3U9F6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf166Q3U9F6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf166Q3U9F6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf166Q3U9F6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf166Q3U9F6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf166Q3U9F6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf166Q3U9F6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf166Q3U9F6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf166Q3U9F6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf166Q3U9F6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf166Q3U9F6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf166Q3U9F6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf166Q3U9F6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf166Q3U9F6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf166Q3U9F6 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf166Q3U9F6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf166Q3U9F6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf166Q3U9F6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf166Q3U9F6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf166Q3U9F6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf166Q3U9F6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf166Q3U9F6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf166Q3U9F6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf166Q3U9F6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf166Q3U9F6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf166Q3U9F6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf166Q3U9F6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf166Q3U9F6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf166Q3U9F6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf166Q3U9F6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
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