Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops9Q3U898 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cops9Q3U898 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cops9Q3U898 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cops9Q3U898 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cops9Q3U898 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cops9Q3U898 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cops9Q3U898 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cops9Q3U898 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cops9Q3U898 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cops9Q3U898 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cops9Q3U898 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cops9Q3U898 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cops9Q3U898 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cops9Q3U898 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops9Q3U898 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops9Q3U898 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops9Q3U898 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops9Q3U898 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops9Q3U898 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops9Q3U898 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops9Q3U898 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops9Q3U898 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops9Q3U898 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cops9Q3U898 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cops9Q3U898 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cops9Q3U898 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cops9Q3U898 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cops9Q3U898 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cops9Q3U898 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cops9Q3U898 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cops9Q3U898 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cops9Q3U898 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cops9Q3U898 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cops9Q3U898 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cops9Q3U898 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cops9Q3U898 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cops9Q3U898 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cops9Q3U898 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cops9Q3U898 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cops9Q3U898 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cops9Q3U898 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cops9Q3U898 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cops9Q3U898 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cops9Q3U898 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cops9Q3U898 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cops9Q3U898 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cops9Q3U898 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cops9Q3U898 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cops9Q3U898 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cops9Q3U898 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cops9Q3U898 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cops9Q3U898 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cops9Q3U898 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cops9Q3U898 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cops9Q3U898 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cops9Q3U898 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cops9Q3U898 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cops9Q3U898 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cops9Q3U898 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cops9Q3U898 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cops9Q3U898 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cops9Q3U898 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cops9Q3U898 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops9Q3U898 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops9Q3U898 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops9Q3U898 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops9Q3U898 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops9Q3U898 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops9Q3U898 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops9Q3U898 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops9Q3U898 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops9Q3U898 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Cops9Q3U898 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops9Q3U898 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops9Q3U898 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops9Q3U898 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops9Q3U898 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops9Q3U898 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops9Q3U898 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops9Q3U898 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops9Q3U898 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops9Q3U898 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops9Q3U898 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops9Q3U898 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops9Q3U898 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops9Q3U898 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops9Q3U898 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops9Q3U898 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops9Q3U898 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops9Q3U898 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops9Q3U898 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops9Q3U898 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops9Q3U898 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops9Q3U898 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops9Q3U898 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops9Q3U898 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops9Q3U898 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops9Q3U898 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops9Q3U898 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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