Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6Q4

Pik3r6, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3r6Q3U6Q4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pik3r6Q3U6Q4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Pik3r6Q3U6Q4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pik3r6Q3U6Q4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pik3r6Q3U6Q4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Pik3r6Q3U6Q4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pik3r6Q3U6Q4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pik3r6Q3U6Q4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pik3r6Q3U6Q4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pik3r6Q3U6Q4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pik3r6Q3U6Q4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pik3r6Q3U6Q4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pik3r6Q3U6Q4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pik3r6Q3U6Q4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pik3r6Q3U6Q4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pik3r6Q3U6Q4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pik3r6Q3U6Q4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pik3r6Q3U6Q4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pik3r6Q3U6Q4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pik3r6Q3U6Q4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pik3r6Q3U6Q4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Pik3r6Q3U6Q4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pik3r6Q3U6Q4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pik3r6Q3U6Q4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pik3r6Q3U6Q4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pik3r6Q3U6Q4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pik3r6Q3U6Q4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pik3r6Q3U6Q4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pik3r6Q3U6Q4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pik3r6Q3U6Q4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Pik3r6Q3U6Q4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Pik3r6Q3U6Q4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pik3r6Q3U6Q4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pik3r6Q3U6Q4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pik3r6Q3U6Q4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pik3r6Q3U6Q4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pik3r6Q3U6Q4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pik3r6Q3U6Q4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pik3r6Q3U6Q4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pik3r6Q3U6Q4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pik3r6Q3U6Q4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pik3r6Q3U6Q4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pik3r6Q3U6Q4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pik3r6Q3U6Q4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pik3r6Q3U6Q4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pik3r6Q3U6Q4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pik3r6Q3U6Q4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Pik3r6Q3U6Q4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pik3r6Q3U6Q4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pik3r6Q3U6Q4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pik3r6Q3U6Q4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pik3r6Q3U6Q4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pik3r6Q3U6Q4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pik3r6Q3U6Q4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pik3r6Q3U6Q4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pik3r6Q3U6Q4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pik3r6Q3U6Q4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pik3r6Q3U6Q4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Pik3r6Q3U6Q4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pik3r6Q3U6Q4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pik3r6Q3U6Q4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pik3r6Q3U6Q4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pik3r6Q3U6Q4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pik3r6Q3U6Q4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pik3r6Q3U6Q4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pik3r6Q3U6Q4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pik3r6Q3U6Q4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pik3r6Q3U6Q4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pik3r6Q3U6Q4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pik3r6Q3U6Q4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pik3r6Q3U6Q4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pik3r6Q3U6Q4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pik3r6Q3U6Q4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pik3r6Q3U6Q4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pik3r6Q3U6Q4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pik3r6Q3U6Q4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pik3r6Q3U6Q4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pik3r6Q3U6Q4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pik3r6Q3U6Q4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pik3r6Q3U6Q4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Pik3r6Q3U6Q4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pik3r6Q3U6Q4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pik3r6Q3U6Q4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pik3r6Q3U6Q4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pik3r6Q3U6Q4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pik3r6Q3U6Q4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pik3r6Q3U6Q4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pik3r6Q3U6Q4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Pik3r6Q3U6Q4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pik3r6Q3U6Q4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pik3r6Q3U6Q4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pik3r6Q3U6Q4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pik3r6Q3U6Q4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Pik3r6Q3U6Q4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pik3r6Q3U6Q4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pik3r6Q3U6Q4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pik3r6Q3U6Q4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pik3r6Q3U6Q4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pik3r6Q3U6Q4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pik3r6Q3U6Q4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms