Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S8

Hvcn1, Voltage-gated hydrogen channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hvcn1Q3U2S8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hvcn1Q3U2S8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hvcn1Q3U2S8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hvcn1Q3U2S8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hvcn1Q3U2S8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hvcn1Q3U2S8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hvcn1Q3U2S8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hvcn1Q3U2S8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hvcn1Q3U2S8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hvcn1Q3U2S8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hvcn1Q3U2S8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hvcn1Q3U2S8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hvcn1Q3U2S8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hvcn1Q3U2S8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hvcn1Q3U2S8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hvcn1Q3U2S8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hvcn1Q3U2S8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hvcn1Q3U2S8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hvcn1Q3U2S8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hvcn1Q3U2S8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hvcn1Q3U2S8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hvcn1Q3U2S8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hvcn1Q3U2S8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hvcn1Q3U2S8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hvcn1Q3U2S8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hvcn1Q3U2S8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hvcn1Q3U2S8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hvcn1Q3U2S8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hvcn1Q3U2S8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hvcn1Q3U2S8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hvcn1Q3U2S8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hvcn1Q3U2S8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Hvcn1Q3U2S8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hvcn1Q3U2S8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hvcn1Q3U2S8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hvcn1Q3U2S8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hvcn1Q3U2S8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hvcn1Q3U2S8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hvcn1Q3U2S8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hvcn1Q3U2S8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hvcn1Q3U2S8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hvcn1Q3U2S8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Hvcn1Q3U2S8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Hvcn1Q3U2S8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Hvcn1Q3U2S8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Hvcn1Q3U2S8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hvcn1Q3U2S8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hvcn1Q3U2S8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hvcn1Q3U2S8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hvcn1Q3U2S8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hvcn1Q3U2S8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hvcn1Q3U2S8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hvcn1Q3U2S8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hvcn1Q3U2S8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hvcn1Q3U2S8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Hvcn1Q3U2S8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hvcn1Q3U2S8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hvcn1Q3U2S8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hvcn1Q3U2S8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Hvcn1Q3U2S8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hvcn1Q3U2S8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hvcn1Q3U2S8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hvcn1Q3U2S8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hvcn1Q3U2S8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hvcn1Q3U2S8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hvcn1Q3U2S8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hvcn1Q3U2S8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hvcn1Q3U2S8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hvcn1Q3U2S8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hvcn1Q3U2S8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hvcn1Q3U2S8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hvcn1Q3U2S8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hvcn1Q3U2S8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hvcn1Q3U2S8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hvcn1Q3U2S8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hvcn1Q3U2S8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Hvcn1Q3U2S8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Hvcn1Q3U2S8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Hvcn1Q3U2S8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hvcn1Q3U2S8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hvcn1Q3U2S8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hvcn1Q3U2S8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hvcn1Q3U2S8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hvcn1Q3U2S8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hvcn1Q3U2S8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hvcn1Q3U2S8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hvcn1Q3U2S8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hvcn1Q3U2S8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hvcn1Q3U2S8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hvcn1Q3U2S8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hvcn1Q3U2S8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hvcn1Q3U2S8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hvcn1Q3U2S8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hvcn1Q3U2S8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hvcn1Q3U2S8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hvcn1Q3U2S8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hvcn1Q3U2S8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hvcn1Q3U2S8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hvcn1Q3U2S8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hvcn1Q3U2S8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms