Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0K8

Ogfod1, Prolyl 3-hydroxylase OGFOD1, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ogfod1Q3U0K8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ogfod1Q3U0K8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ogfod1Q3U0K8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ogfod1Q3U0K8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ogfod1Q3U0K8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ogfod1Q3U0K8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ogfod1Q3U0K8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ogfod1Q3U0K8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ogfod1Q3U0K8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ogfod1Q3U0K8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ogfod1Q3U0K8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ogfod1Q3U0K8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ogfod1Q3U0K8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ogfod1Q3U0K8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ogfod1Q3U0K8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ogfod1Q3U0K8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ogfod1Q3U0K8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ogfod1Q3U0K8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ogfod1Q3U0K8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ogfod1Q3U0K8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ogfod1Q3U0K8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ogfod1Q3U0K8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ogfod1Q3U0K8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ogfod1Q3U0K8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ogfod1Q3U0K8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ogfod1Q3U0K8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ogfod1Q3U0K8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ogfod1Q3U0K8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ogfod1Q3U0K8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ogfod1Q3U0K8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ogfod1Q3U0K8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ogfod1Q3U0K8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ogfod1Q3U0K8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ogfod1Q3U0K8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ogfod1Q3U0K8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ogfod1Q3U0K8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ogfod1Q3U0K8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ogfod1Q3U0K8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ogfod1Q3U0K8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ogfod1Q3U0K8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ogfod1Q3U0K8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ogfod1Q3U0K8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ogfod1Q3U0K8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ogfod1Q3U0K8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ogfod1Q3U0K8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ogfod1Q3U0K8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ogfod1Q3U0K8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ogfod1Q3U0K8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ogfod1Q3U0K8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ogfod1Q3U0K8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ogfod1Q3U0K8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ogfod1Q3U0K8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ogfod1Q3U0K8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ogfod1Q3U0K8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ogfod1Q3U0K8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ogfod1Q3U0K8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ogfod1Q3U0K8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ogfod1Q3U0K8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ogfod1Q3U0K8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ogfod1Q3U0K8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ogfod1Q3U0K8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ogfod1Q3U0K8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ogfod1Q3U0K8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ogfod1Q3U0K8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ogfod1Q3U0K8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ogfod1Q3U0K8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ogfod1Q3U0K8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ogfod1Q3U0K8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ogfod1Q3U0K8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ogfod1Q3U0K8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ogfod1Q3U0K8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ogfod1Q3U0K8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ogfod1Q3U0K8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ogfod1Q3U0K8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ogfod1Q3U0K8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ogfod1Q3U0K8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ogfod1Q3U0K8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ogfod1Q3U0K8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ogfod1Q3U0K8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ogfod1Q3U0K8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ogfod1Q3U0K8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ogfod1Q3U0K8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ogfod1Q3U0K8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ogfod1Q3U0K8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ogfod1Q3U0K8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ogfod1Q3U0K8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ogfod1Q3U0K8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ogfod1Q3U0K8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ogfod1Q3U0K8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ogfod1Q3U0K8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ogfod1Q3U0K8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ogfod1Q3U0K8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ogfod1Q3U0K8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ogfod1Q3U0K8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ogfod1Q3U0K8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ogfod1Q3U0K8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ogfod1Q3U0K8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ogfod1Q3U0K8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ogfod1Q3U0K8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ogfod1Q3U0K8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms