Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXX4

Slc17a7, Vesicular glutamate transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc17a7Q3TXX4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc17a7Q3TXX4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc17a7Q3TXX4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc17a7Q3TXX4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc17a7Q3TXX4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc17a7Q3TXX4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc17a7Q3TXX4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc17a7Q3TXX4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc17a7Q3TXX4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc17a7Q3TXX4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc17a7Q3TXX4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc17a7Q3TXX4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc17a7Q3TXX4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc17a7Q3TXX4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc17a7Q3TXX4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc17a7Q3TXX4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc17a7Q3TXX4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc17a7Q3TXX4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc17a7Q3TXX4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc17a7Q3TXX4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc17a7Q3TXX4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc17a7Q3TXX4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc17a7Q3TXX4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc17a7Q3TXX4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc17a7Q3TXX4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc17a7Q3TXX4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc17a7Q3TXX4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc17a7Q3TXX4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc17a7Q3TXX4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc17a7Q3TXX4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc17a7Q3TXX4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc17a7Q3TXX4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc17a7Q3TXX4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc17a7Q3TXX4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc17a7Q3TXX4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc17a7Q3TXX4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc17a7Q3TXX4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc17a7Q3TXX4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc17a7Q3TXX4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc17a7Q3TXX4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc17a7Q3TXX4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc17a7Q3TXX4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc17a7Q3TXX4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc17a7Q3TXX4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc17a7Q3TXX4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc17a7Q3TXX4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc17a7Q3TXX4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc17a7Q3TXX4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc17a7Q3TXX4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc17a7Q3TXX4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc17a7Q3TXX4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc17a7Q3TXX4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc17a7Q3TXX4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc17a7Q3TXX4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc17a7Q3TXX4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc17a7Q3TXX4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc17a7Q3TXX4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc17a7Q3TXX4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Slc17a7Q3TXX4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc17a7Q3TXX4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc17a7Q3TXX4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc17a7Q3TXX4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc17a7Q3TXX4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc17a7Q3TXX4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc17a7Q3TXX4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Slc17a7Q3TXX4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Slc17a7Q3TXX4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Slc17a7Q3TXX4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc17a7Q3TXX4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Slc17a7Q3TXX4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc17a7Q3TXX4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc17a7Q3TXX4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc17a7Q3TXX4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
Slc17a7Q3TXX4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc17a7Q3TXX4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Slc17a7Q3TXX4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Slc17a7Q3TXX4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc17a7Q3TXX4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc17a7Q3TXX4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc17a7Q3TXX4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Slc17a7Q3TXX4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Slc17a7Q3TXX4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc17a7Q3TXX4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc17a7Q3TXX4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc17a7Q3TXX4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc17a7Q3TXX4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc17a7Q3TXX4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc17a7Q3TXX4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc17a7Q3TXX4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc17a7Q3TXX4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc17a7Q3TXX4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc17a7Q3TXX4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc17a7Q3TXX4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc17a7Q3TXX4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc17a7Q3TXX4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc17a7Q3TXX4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc17a7Q3TXX4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc17a7Q3TXX4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc17a7Q3TXX4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc17a7Q3TXX4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms