Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXX3

Zfyve27, Protrudin, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfyve27Q3TXX3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfyve27Q3TXX3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfyve27Q3TXX3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zfyve27Q3TXX3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zfyve27Q3TXX3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zfyve27Q3TXX3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zfyve27Q3TXX3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zfyve27Q3TXX3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zfyve27Q3TXX3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zfyve27Q3TXX3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zfyve27Q3TXX3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zfyve27Q3TXX3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zfyve27Q3TXX3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zfyve27Q3TXX3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zfyve27Q3TXX3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zfyve27Q3TXX3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zfyve27Q3TXX3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zfyve27Q3TXX3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zfyve27Q3TXX3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zfyve27Q3TXX3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zfyve27Q3TXX3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zfyve27Q3TXX3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zfyve27Q3TXX3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zfyve27Q3TXX3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zfyve27Q3TXX3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zfyve27Q3TXX3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zfyve27Q3TXX3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zfyve27Q3TXX3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zfyve27Q3TXX3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zfyve27Q3TXX3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zfyve27Q3TXX3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zfyve27Q3TXX3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zfyve27Q3TXX3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zfyve27Q3TXX3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zfyve27Q3TXX3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zfyve27Q3TXX3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zfyve27Q3TXX3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zfyve27Q3TXX3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Zfyve27Q3TXX3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zfyve27Q3TXX3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zfyve27Q3TXX3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zfyve27Q3TXX3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Zfyve27Q3TXX3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Zfyve27Q3TXX3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zfyve27Q3TXX3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zfyve27Q3TXX3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zfyve27Q3TXX3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Zfyve27Q3TXX3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zfyve27Q3TXX3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zfyve27Q3TXX3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zfyve27Q3TXX3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zfyve27Q3TXX3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zfyve27Q3TXX3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Zfyve27Q3TXX3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Zfyve27Q3TXX3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zfyve27Q3TXX3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zfyve27Q3TXX3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zfyve27Q3TXX3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zfyve27Q3TXX3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zfyve27Q3TXX3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zfyve27Q3TXX3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zfyve27Q3TXX3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zfyve27Q3TXX3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zfyve27Q3TXX3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zfyve27Q3TXX3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zfyve27Q3TXX3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zfyve27Q3TXX3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zfyve27Q3TXX3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zfyve27Q3TXX3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zfyve27Q3TXX3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zfyve27Q3TXX3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zfyve27Q3TXX3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Zfyve27Q3TXX3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zfyve27Q3TXX3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zfyve27Q3TXX3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zfyve27Q3TXX3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Zfyve27Q3TXX3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zfyve27Q3TXX3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zfyve27Q3TXX3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zfyve27Q3TXX3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Zfyve27Q3TXX3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Zfyve27Q3TXX3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zfyve27Q3TXX3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zfyve27Q3TXX3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zfyve27Q3TXX3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zfyve27Q3TXX3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zfyve27Q3TXX3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zfyve27Q3TXX3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zfyve27Q3TXX3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zfyve27Q3TXX3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zfyve27Q3TXX3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zfyve27Q3TXX3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zfyve27Q3TXX3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zfyve27Q3TXX3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zfyve27Q3TXX3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zfyve27Q3TXX3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zfyve27Q3TXX3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zfyve27Q3TXX3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zfyve27Q3TXX3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zfyve27Q3TXX3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.8 ms