Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXS7

Psmd1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd1Q3TXS7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Psmd1Q3TXS7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Psmd1Q3TXS7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Psmd1Q3TXS7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Psmd1Q3TXS7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Psmd1Q3TXS7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Psmd1Q3TXS7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Psmd1Q3TXS7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Psmd1Q3TXS7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Psmd1Q3TXS7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Psmd1Q3TXS7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Psmd1Q3TXS7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Psmd1Q3TXS7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Psmd1Q3TXS7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Psmd1Q3TXS7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Psmd1Q3TXS7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Psmd1Q3TXS7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Psmd1Q3TXS7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Psmd1Q3TXS7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Psmd1Q3TXS7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Psmd1Q3TXS7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Psmd1Q3TXS7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Psmd1Q3TXS7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Psmd1Q3TXS7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Psmd1Q3TXS7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Psmd1Q3TXS7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Psmd1Q3TXS7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Psmd1Q3TXS7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Psmd1Q3TXS7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Psmd1Q3TXS7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Psmd1Q3TXS7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Psmd1Q3TXS7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Psmd1Q3TXS7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Psmd1Q3TXS7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Psmd1Q3TXS7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Psmd1Q3TXS7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Psmd1Q3TXS7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Psmd1Q3TXS7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Psmd1Q3TXS7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Psmd1Q3TXS7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Psmd1Q3TXS7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Psmd1Q3TXS7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Psmd1Q3TXS7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Psmd1Q3TXS7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Psmd1Q3TXS7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Psmd1Q3TXS7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Psmd1Q3TXS7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Psmd1Q3TXS7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Psmd1Q3TXS7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Psmd1Q3TXS7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Psmd1Q3TXS7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Psmd1Q3TXS7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Psmd1Q3TXS7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Psmd1Q3TXS7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Psmd1Q3TXS7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Psmd1Q3TXS7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Psmd1Q3TXS7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Psmd1Q3TXS7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Psmd1Q3TXS7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Psmd1Q3TXS7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Psmd1Q3TXS7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Psmd1Q3TXS7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Psmd1Q3TXS7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Psmd1Q3TXS7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Psmd1Q3TXS7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Psmd1Q3TXS7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Psmd1Q3TXS7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Psmd1Q3TXS7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Psmd1Q3TXS7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Psmd1Q3TXS7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Psmd1Q3TXS7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Psmd1Q3TXS7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Psmd1Q3TXS7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Psmd1Q3TXS7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Psmd1Q3TXS7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Psmd1Q3TXS7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Psmd1Q3TXS7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Psmd1Q3TXS7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Psmd1Q3TXS7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Psmd1Q3TXS7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Psmd1Q3TXS7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Psmd1Q3TXS7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Psmd1Q3TXS7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Psmd1Q3TXS7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Psmd1Q3TXS7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Psmd1Q3TXS7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Psmd1Q3TXS7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Psmd1Q3TXS7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Psmd1Q3TXS7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Psmd1Q3TXS7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Psmd1Q3TXS7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Psmd1Q3TXS7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Psmd1Q3TXS7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Psmd1Q3TXS7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Psmd1Q3TXS7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Psmd1Q3TXS7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Psmd1Q3TXS7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Psmd1Q3TXS7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Psmd1Q3TXS7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Psmd1Q3TXS7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms