Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTL0

Uncharacterized protein C3orf38 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTL0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q3TTL0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q3TTL0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Q3TTL0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Q3TTL0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q3TTL0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q3TTL0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q3TTL0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Q3TTL0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q3TTL0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Q3TTL0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q3TTL0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Q3TTL0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q3TTL0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q3TTL0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q3TTL0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q3TTL0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q3TTL0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q3TTL0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q3TTL0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q3TTL0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q3TTL0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q3TTL0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q3TTL0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q3TTL0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q3TTL0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Q3TTL0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q3TTL0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q3TTL0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q3TTL0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q3TTL0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Q3TTL0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Q3TTL0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q3TTL0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q3TTL0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q3TTL0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q3TTL0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q3TTL0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q3TTL0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q3TTL0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q3TTL0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q3TTL0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q3TTL0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q3TTL0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q3TTL0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q3TTL0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q3TTL0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q3TTL0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Q3TTL0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q3TTL0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q3TTL0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q3TTL0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q3TTL0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q3TTL0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q3TTL0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q3TTL0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Q3TTL0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Q3TTL0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q3TTL0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q3TTL0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q3TTL0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q3TTL0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q3TTL0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q3TTL0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q3TTL0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q3TTL0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q3TTL0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q3TTL0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q3TTL0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q3TTL0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q3TTL0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q3TTL0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q3TTL0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q3TTL0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q3TTL0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q3TTL0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q3TTL0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q3TTL0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q3TTL0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q3TTL0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q3TTL0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q3TTL0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q3TTL0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q3TTL0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q3TTL0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q3TTL0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q3TTL0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q3TTL0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q3TTL0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q3TTL0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q3TTL0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q3TTL0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q3TTL0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q3TTL0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Q3TTL0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q3TTL0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q3TTL0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q3TTL0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q3TTL0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Q3TTL0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms