Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTD8

Gm21440, Predicted gene, 20737, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21440Q3TTD8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21440Q3TTD8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21440Q3TTD8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21440Q3TTD8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21440Q3TTD8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21440Q3TTD8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21440Q3TTD8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21440Q3TTD8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21440Q3TTD8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21440Q3TTD8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21440Q3TTD8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21440Q3TTD8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21440Q3TTD8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21440Q3TTD8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21440Q3TTD8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21440Q3TTD8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21440Q3TTD8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21440Q3TTD8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21440Q3TTD8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21440Q3TTD8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21440Q3TTD8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21440Q3TTD8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21440Q3TTD8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21440Q3TTD8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21440Q3TTD8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21440Q3TTD8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21440Q3TTD8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21440Q3TTD8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21440Q3TTD8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21440Q3TTD8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21440Q3TTD8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21440Q3TTD8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21440Q3TTD8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21440Q3TTD8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21440Q3TTD8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21440Q3TTD8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21440Q3TTD8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21440Q3TTD8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21440Q3TTD8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21440Q3TTD8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21440Q3TTD8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21440Q3TTD8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21440Q3TTD8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21440Q3TTD8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21440Q3TTD8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21440Q3TTD8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21440Q3TTD8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21440Q3TTD8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21440Q3TTD8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21440Q3TTD8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21440Q3TTD8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21440Q3TTD8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21440Q3TTD8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21440Q3TTD8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21440Q3TTD8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm21440Q3TTD8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21440Q3TTD8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21440Q3TTD8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21440Q3TTD8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21440Q3TTD8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21440Q3TTD8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21440Q3TTD8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21440Q3TTD8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21440Q3TTD8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21440Q3TTD8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21440Q3TTD8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21440Q3TTD8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21440Q3TTD8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21440Q3TTD8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21440Q3TTD8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21440Q3TTD8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21440Q3TTD8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21440Q3TTD8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21440Q3TTD8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21440Q3TTD8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21440Q3TTD8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21440Q3TTD8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21440Q3TTD8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21440Q3TTD8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21440Q3TTD8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21440Q3TTD8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21440Q3TTD8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21440Q3TTD8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21440Q3TTD8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21440Q3TTD8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21440Q3TTD8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21440Q3TTD8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21440Q3TTD8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21440Q3TTD8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21440Q3TTD8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21440Q3TTD8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21440Q3TTD8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21440Q3TTD8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21440Q3TTD8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21440Q3TTD8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21440Q3TTD8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21440Q3TTD8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21440Q3TTD8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21440Q3TTD8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21440Q3TTD8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.8 ms