Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prr27Q3SYJ2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prr27Q3SYJ2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prr27Q3SYJ2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prr27Q3SYJ2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prr27Q3SYJ2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prr27Q3SYJ2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prr27Q3SYJ2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prr27Q3SYJ2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prr27Q3SYJ2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prr27Q3SYJ2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prr27Q3SYJ2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prr27Q3SYJ2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prr27Q3SYJ2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Prr27Q3SYJ2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prr27Q3SYJ2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prr27Q3SYJ2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prr27Q3SYJ2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prr27Q3SYJ2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prr27Q3SYJ2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prr27Q3SYJ2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prr27Q3SYJ2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prr27Q3SYJ2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prr27Q3SYJ2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prr27Q3SYJ2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Prr27Q3SYJ2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prr27Q3SYJ2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prr27Q3SYJ2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prr27Q3SYJ2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prr27Q3SYJ2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prr27Q3SYJ2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prr27Q3SYJ2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prr27Q3SYJ2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prr27Q3SYJ2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Prr27Q3SYJ2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prr27Q3SYJ2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prr27Q3SYJ2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prr27Q3SYJ2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prr27Q3SYJ2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prr27Q3SYJ2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prr27Q3SYJ2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prr27Q3SYJ2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Prr27Q3SYJ2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prr27Q3SYJ2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prr27Q3SYJ2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prr27Q3SYJ2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prr27Q3SYJ2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prr27Q3SYJ2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prr27Q3SYJ2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prr27Q3SYJ2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prr27Q3SYJ2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prr27Q3SYJ2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prr27Q3SYJ2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prr27Q3SYJ2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prr27Q3SYJ2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prr27Q3SYJ2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prr27Q3SYJ2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prr27Q3SYJ2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prr27Q3SYJ2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prr27Q3SYJ2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prr27Q3SYJ2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prr27Q3SYJ2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Prr27Q3SYJ2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prr27Q3SYJ2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prr27Q3SYJ2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prr27Q3SYJ2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prr27Q3SYJ2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prr27Q3SYJ2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prr27Q3SYJ2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prr27Q3SYJ2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prr27Q3SYJ2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prr27Q3SYJ2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prr27Q3SYJ2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prr27Q3SYJ2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prr27Q3SYJ2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prr27Q3SYJ2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prr27Q3SYJ2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prr27Q3SYJ2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prr27Q3SYJ2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Prr27Q3SYJ2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prr27Q3SYJ2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prr27Q3SYJ2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prr27Q3SYJ2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prr27Q3SYJ2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prr27Q3SYJ2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prr27Q3SYJ2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prr27Q3SYJ2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prr27Q3SYJ2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prr27Q3SYJ2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prr27Q3SYJ2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prr27Q3SYJ2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prr27Q3SYJ2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prr27Q3SYJ2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prr27Q3SYJ2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prr27Q3SYJ2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prr27Q3SYJ2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prr27Q3SYJ2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Prr27Q3SYJ2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prr27Q3SYJ2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Prr27Q3SYJ2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms