Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hddc2Q3SXD3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hddc2Q3SXD3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hddc2Q3SXD3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hddc2Q3SXD3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hddc2Q3SXD3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hddc2Q3SXD3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hddc2Q3SXD3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hddc2Q3SXD3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hddc2Q3SXD3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hddc2Q3SXD3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hddc2Q3SXD3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hddc2Q3SXD3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hddc2Q3SXD3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hddc2Q3SXD3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hddc2Q3SXD3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hddc2Q3SXD3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hddc2Q3SXD3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hddc2Q3SXD3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hddc2Q3SXD3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hddc2Q3SXD3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hddc2Q3SXD3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hddc2Q3SXD3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hddc2Q3SXD3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hddc2Q3SXD3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hddc2Q3SXD3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Hddc2Q3SXD3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hddc2Q3SXD3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hddc2Q3SXD3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hddc2Q3SXD3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hddc2Q3SXD3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hddc2Q3SXD3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hddc2Q3SXD3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hddc2Q3SXD3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hddc2Q3SXD3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hddc2Q3SXD3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hddc2Q3SXD3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hddc2Q3SXD3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hddc2Q3SXD3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hddc2Q3SXD3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hddc2Q3SXD3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hddc2Q3SXD3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Hddc2Q3SXD3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hddc2Q3SXD3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hddc2Q3SXD3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hddc2Q3SXD3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hddc2Q3SXD3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hddc2Q3SXD3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hddc2Q3SXD3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hddc2Q3SXD3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hddc2Q3SXD3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hddc2Q3SXD3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hddc2Q3SXD3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Hddc2Q3SXD3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hddc2Q3SXD3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hddc2Q3SXD3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hddc2Q3SXD3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hddc2Q3SXD3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hddc2Q3SXD3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hddc2Q3SXD3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hddc2Q3SXD3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hddc2Q3SXD3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hddc2Q3SXD3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hddc2Q3SXD3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hddc2Q3SXD3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hddc2Q3SXD3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hddc2Q3SXD3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hddc2Q3SXD3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hddc2Q3SXD3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hddc2Q3SXD3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hddc2Q3SXD3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hddc2Q3SXD3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hddc2Q3SXD3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hddc2Q3SXD3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hddc2Q3SXD3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hddc2Q3SXD3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hddc2Q3SXD3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hddc2Q3SXD3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hddc2Q3SXD3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hddc2Q3SXD3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hddc2Q3SXD3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hddc2Q3SXD3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hddc2Q3SXD3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hddc2Q3SXD3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hddc2Q3SXD3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hddc2Q3SXD3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hddc2Q3SXD3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hddc2Q3SXD3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hddc2Q3SXD3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hddc2Q3SXD3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hddc2Q3SXD3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hddc2Q3SXD3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hddc2Q3SXD3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hddc2Q3SXD3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Hddc2Q3SXD3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hddc2Q3SXD3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hddc2Q3SXD3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hddc2Q3SXD3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hddc2Q3SXD3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hddc2Q3SXD3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms