Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNM2

March5, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH5, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
March5Q3KNM2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
March5Q3KNM2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
March5Q3KNM2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
March5Q3KNM2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
March5Q3KNM2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
March5Q3KNM2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
March5Q3KNM2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
March5Q3KNM2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
March5Q3KNM2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
March5Q3KNM2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
March5Q3KNM2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
March5Q3KNM2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
March5Q3KNM2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
March5Q3KNM2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
March5Q3KNM2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
March5Q3KNM2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
March5Q3KNM2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
March5Q3KNM2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
March5Q3KNM2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
March5Q3KNM2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
March5Q3KNM2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
March5Q3KNM2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
March5Q3KNM2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
March5Q3KNM2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
March5Q3KNM2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
March5Q3KNM2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
March5Q3KNM2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
March5Q3KNM2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
March5Q3KNM2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
March5Q3KNM2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
March5Q3KNM2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
March5Q3KNM2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
March5Q3KNM2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
March5Q3KNM2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
March5Q3KNM2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
March5Q3KNM2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
March5Q3KNM2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
March5Q3KNM2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
March5Q3KNM2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
March5Q3KNM2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
March5Q3KNM2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
March5Q3KNM2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
March5Q3KNM2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
March5Q3KNM2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
March5Q3KNM2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
March5Q3KNM2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
March5Q3KNM2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
March5Q3KNM2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
March5Q3KNM2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
March5Q3KNM2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
March5Q3KNM2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
March5Q3KNM2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
March5Q3KNM2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
March5Q3KNM2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
March5Q3KNM2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
March5Q3KNM2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
March5Q3KNM2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
March5Q3KNM2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
March5Q3KNM2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
March5Q3KNM2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
March5Q3KNM2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
March5Q3KNM2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
March5Q3KNM2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
March5Q3KNM2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
March5Q3KNM2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
March5Q3KNM2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
March5Q3KNM2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
March5Q3KNM2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
March5Q3KNM2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
March5Q3KNM2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
March5Q3KNM2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
March5Q3KNM2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
March5Q3KNM2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
March5Q3KNM2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
March5Q3KNM2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
March5Q3KNM2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
March5Q3KNM2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
March5Q3KNM2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
March5Q3KNM2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
March5Q3KNM2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
March5Q3KNM2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
March5Q3KNM2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
March5Q3KNM2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
March5Q3KNM2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
March5Q3KNM2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
March5Q3KNM2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
March5Q3KNM2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
March5Q3KNM2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
March5Q3KNM2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
March5Q3KNM2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
March5Q3KNM2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
March5Q3KNM2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
March5Q3KNM2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
March5Q3KNM2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
March5Q3KNM2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
March5Q3KNM2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
March5Q3KNM2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
March5Q3KNM2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
March5Q3KNM2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
March5Q3KNM2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms