Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spatc1Q148B6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spatc1Q148B6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spatc1Q148B6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Spatc1Q148B6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spatc1Q148B6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spatc1Q148B6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spatc1Q148B6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spatc1Q148B6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spatc1Q148B6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spatc1Q148B6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spatc1Q148B6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spatc1Q148B6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spatc1Q148B6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spatc1Q148B6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spatc1Q148B6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spatc1Q148B6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spatc1Q148B6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spatc1Q148B6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spatc1Q148B6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spatc1Q148B6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spatc1Q148B6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spatc1Q148B6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spatc1Q148B6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Spatc1Q148B6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spatc1Q148B6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spatc1Q148B6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spatc1Q148B6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spatc1Q148B6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Spatc1Q148B6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spatc1Q148B6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spatc1Q148B6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spatc1Q148B6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spatc1Q148B6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Spatc1Q148B6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spatc1Q148B6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spatc1Q148B6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spatc1Q148B6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spatc1Q148B6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Spatc1Q148B6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spatc1Q148B6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spatc1Q148B6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spatc1Q148B6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spatc1Q148B6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spatc1Q148B6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spatc1Q148B6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spatc1Q148B6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spatc1Q148B6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spatc1Q148B6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spatc1Q148B6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spatc1Q148B6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spatc1Q148B6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spatc1Q148B6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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Spatc1Q148B6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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Spatc1Q148B6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spatc1Q148B6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spatc1Q148B6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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Spatc1Q148B6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spatc1Q148B6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spatc1Q148B6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spatc1Q148B6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spatc1Q148B6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spatc1Q148B6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spatc1Q148B6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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Spatc1Q148B6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spatc1Q148B6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spatc1Q148B6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spatc1Q148B6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spatc1Q148B6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spatc1Q148B6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spatc1Q148B6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spatc1Q148B6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spatc1Q148B6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Spatc1Q148B6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spatc1Q148B6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spatc1Q148B6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spatc1Q148B6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spatc1Q148B6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Spatc1Q148B6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spatc1Q148B6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spatc1Q148B6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spatc1Q148B6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spatc1Q148B6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spatc1Q148B6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spatc1Q148B6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spatc1Q148B6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spatc1Q148B6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spatc1Q148B6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Spatc1Q148B6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Spatc1Q148B6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Spatc1Q148B6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spatc1Q148B6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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