Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Samd12Q0VE29 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Samd12Q0VE29 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Samd12Q0VE29 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Samd12Q0VE29 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Samd12Q0VE29 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Samd12Q0VE29 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Samd12Q0VE29 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Samd12Q0VE29 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Samd12Q0VE29 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Samd12Q0VE29 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Samd12Q0VE29 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Samd12Q0VE29 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Samd12Q0VE29 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Samd12Q0VE29 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Samd12Q0VE29 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Samd12Q0VE29 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Samd12Q0VE29 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Samd12Q0VE29 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Samd12Q0VE29 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Samd12Q0VE29 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Samd12Q0VE29 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Samd12Q0VE29 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Samd12Q0VE29 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Samd12Q0VE29 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Samd12Q0VE29 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Samd12Q0VE29 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Samd12Q0VE29 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Samd12Q0VE29 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Samd12Q0VE29 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Samd12Q0VE29 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Samd12Q0VE29 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Samd12Q0VE29 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Samd12Q0VE29 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Samd12Q0VE29 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Samd12Q0VE29 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Samd12Q0VE29 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Samd12Q0VE29 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Samd12Q0VE29 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Samd12Q0VE29 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Samd12Q0VE29 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Samd12Q0VE29 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Samd12Q0VE29 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Samd12Q0VE29 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Samd12Q0VE29 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Samd12Q0VE29 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Samd12Q0VE29 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Samd12Q0VE29 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Samd12Q0VE29 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Samd12Q0VE29 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Samd12Q0VE29 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Samd12Q0VE29 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Samd12Q0VE29 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Samd12Q0VE29 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Samd12Q0VE29 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Samd12Q0VE29 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Samd12Q0VE29 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Samd12Q0VE29 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Samd12Q0VE29 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Samd12Q0VE29 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Samd12Q0VE29 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Samd12Q0VE29 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Samd12Q0VE29 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Samd12Q0VE29 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Samd12Q0VE29 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Samd12Q0VE29 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Samd12Q0VE29 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Samd12Q0VE29 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Samd12Q0VE29 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Samd12Q0VE29 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Samd12Q0VE29 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Samd12Q0VE29 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Samd12Q0VE29 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Samd12Q0VE29 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Samd12Q0VE29 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Samd12Q0VE29 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Samd12Q0VE29 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Samd12Q0VE29 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Samd12Q0VE29 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Samd12Q0VE29 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Samd12Q0VE29 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Samd12Q0VE29 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Samd12Q0VE29 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Samd12Q0VE29 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Samd12Q0VE29 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samd12Q0VE29 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samd12Q0VE29 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samd12Q0VE29 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samd12Q0VE29 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samd12Q0VE29 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samd12Q0VE29 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samd12Q0VE29 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samd12Q0VE29 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samd12Q0VE29 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samd12Q0VE29 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Samd12Q0VE29 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samd12Q0VE29 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samd12Q0VE29 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samd12Q0VE29 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samd12Q0VE29 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms