Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Calb2Q08331 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Calb2Q08331 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Calb2Q08331 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Calb2Q08331 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Calb2Q08331 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Calb2Q08331 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Calb2Q08331 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Calb2Q08331 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Calb2Q08331 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Calb2Q08331 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Calb2Q08331 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Calb2Q08331 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Calb2Q08331 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Calb2Q08331 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Calb2Q08331 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Calb2Q08331 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Calb2Q08331 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Calb2Q08331 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Calb2Q08331 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Calb2Q08331 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Calb2Q08331 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Calb2Q08331 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Calb2Q08331 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Calb2Q08331 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Calb2Q08331 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Calb2Q08331 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Calb2Q08331 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Calb2Q08331 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Calb2Q08331 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Calb2Q08331 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Calb2Q08331 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Calb2Q08331 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Calb2Q08331 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Calb2Q08331 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Calb2Q08331 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Calb2Q08331 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Calb2Q08331 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Calb2Q08331 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Calb2Q08331 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Calb2Q08331 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Calb2Q08331 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Calb2Q08331 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Calb2Q08331 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Calb2Q08331 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Calb2Q08331 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Calb2Q08331 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Calb2Q08331 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Calb2Q08331 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Calb2Q08331 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Calb2Q08331 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Calb2Q08331 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Calb2Q08331 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Calb2Q08331 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Calb2Q08331 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Calb2Q08331 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Calb2Q08331 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Calb2Q08331 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Calb2Q08331 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Calb2Q08331 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Calb2Q08331 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Calb2Q08331 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Calb2Q08331 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Calb2Q08331 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Calb2Q08331 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Calb2Q08331 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Calb2Q08331 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Calb2Q08331 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Calb2Q08331 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Calb2Q08331 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Calb2Q08331 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Calb2Q08331 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Calb2Q08331 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Calb2Q08331 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Calb2Q08331 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Calb2Q08331 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Calb2Q08331 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Calb2Q08331 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Calb2Q08331 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Calb2Q08331 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Calb2Q08331 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Calb2Q08331 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Calb2Q08331 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Calb2Q08331 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Calb2Q08331 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Calb2Q08331 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Calb2Q08331 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Calb2Q08331 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Calb2Q08331 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Calb2Q08331 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Calb2Q08331 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Calb2Q08331 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Calb2Q08331 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Calb2Q08331 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Calb2Q08331 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Calb2Q08331 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Calb2Q08331 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Calb2Q08331 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Calb2Q08331 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Calb2Q08331 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms