Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tgm3Q08189 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tgm3Q08189 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tgm3Q08189 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tgm3Q08189 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Tgm3Q08189 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Tgm3Q08189 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tgm3Q08189 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tgm3Q08189 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tgm3Q08189 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tgm3Q08189 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tgm3Q08189 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tgm3Q08189 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tgm3Q08189 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tgm3Q08189 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tgm3Q08189 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tgm3Q08189 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tgm3Q08189 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tgm3Q08189 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tgm3Q08189 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tgm3Q08189 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tgm3Q08189 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tgm3Q08189 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tgm3Q08189 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tgm3Q08189 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tgm3Q08189 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tgm3Q08189 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tgm3Q08189 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tgm3Q08189 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Tgm3Q08189 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tgm3Q08189 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tgm3Q08189 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tgm3Q08189 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tgm3Q08189 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tgm3Q08189 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tgm3Q08189 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tgm3Q08189 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tgm3Q08189 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tgm3Q08189 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tgm3Q08189 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tgm3Q08189 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tgm3Q08189 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tgm3Q08189 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tgm3Q08189 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Tgm3Q08189 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tgm3Q08189 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tgm3Q08189 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tgm3Q08189 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tgm3Q08189 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tgm3Q08189 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tgm3Q08189 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tgm3Q08189 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tgm3Q08189 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tgm3Q08189 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tgm3Q08189 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tgm3Q08189 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Tgm3Q08189 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Tgm3Q08189 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tgm3Q08189 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tgm3Q08189 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tgm3Q08189 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tgm3Q08189 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tgm3Q08189 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tgm3Q08189 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tgm3Q08189 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Tgm3Q08189 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tgm3Q08189 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tgm3Q08189 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tgm3Q08189 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tgm3Q08189 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tgm3Q08189 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tgm3Q08189 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tgm3Q08189 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tgm3Q08189 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tgm3Q08189 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tgm3Q08189 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tgm3Q08189 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Tgm3Q08189 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tgm3Q08189 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tgm3Q08189 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tgm3Q08189 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tgm3Q08189 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tgm3Q08189 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tgm3Q08189 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tgm3Q08189 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Tgm3Q08189 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tgm3Q08189 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tgm3Q08189 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tgm3Q08189 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tgm3Q08189 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tgm3Q08189 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tgm3Q08189 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tgm3Q08189 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Tgm3Q08189 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tgm3Q08189 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tgm3Q08189 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tgm3Q08189 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tgm3Q08189 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tgm3Q08189 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tgm3Q08189 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms