Protein–RNA interactions for Protein: Q07279

Nfe2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2Q07279 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nfe2Q07279 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nfe2Q07279 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nfe2Q07279 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Nfe2Q07279 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nfe2Q07279 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nfe2Q07279 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nfe2Q07279 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nfe2Q07279 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nfe2Q07279 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nfe2Q07279 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Nfe2Q07279 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nfe2Q07279 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nfe2Q07279 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nfe2Q07279 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nfe2Q07279 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nfe2Q07279 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nfe2Q07279 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nfe2Q07279 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nfe2Q07279 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nfe2Q07279 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nfe2Q07279 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nfe2Q07279 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nfe2Q07279 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nfe2Q07279 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nfe2Q07279 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nfe2Q07279 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nfe2Q07279 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nfe2Q07279 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nfe2Q07279 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Nfe2Q07279 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nfe2Q07279 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nfe2Q07279 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nfe2Q07279 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nfe2Q07279 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Nfe2Q07279 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nfe2Q07279 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nfe2Q07279 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nfe2Q07279 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nfe2Q07279 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nfe2Q07279 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nfe2Q07279 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nfe2Q07279 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nfe2Q07279 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Nfe2Q07279 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nfe2Q07279 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nfe2Q07279 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nfe2Q07279 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nfe2Q07279 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nfe2Q07279 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nfe2Q07279 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Nfe2Q07279 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nfe2Q07279 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nfe2Q07279 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nfe2Q07279 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nfe2Q07279 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nfe2Q07279 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nfe2Q07279 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nfe2Q07279 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nfe2Q07279 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nfe2Q07279 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nfe2Q07279 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nfe2Q07279 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nfe2Q07279 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Nfe2Q07279 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nfe2Q07279 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nfe2Q07279 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nfe2Q07279 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nfe2Q07279 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nfe2Q07279 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nfe2Q07279 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nfe2Q07279 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nfe2Q07279 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Nfe2Q07279 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nfe2Q07279 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nfe2Q07279 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nfe2Q07279 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nfe2Q07279 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nfe2Q07279 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nfe2Q07279 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nfe2Q07279 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nfe2Q07279 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nfe2Q07279 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nfe2Q07279 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nfe2Q07279 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nfe2Q07279 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nfe2Q07279 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Nfe2Q07279 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nfe2Q07279 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nfe2Q07279 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nfe2Q07279 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nfe2Q07279 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nfe2Q07279 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nfe2Q07279 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nfe2Q07279 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nfe2Q07279 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nfe2Q07279 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nfe2Q07279 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nfe2Q07279 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Nfe2Q07279 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms