Protein–RNA interactions for Protein: Q06890

Clu, Clusterin, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CluQ06890 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CluQ06890 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CluQ06890 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CluQ06890 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CluQ06890 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CluQ06890 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CluQ06890 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CluQ06890 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CluQ06890 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CluQ06890 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CluQ06890 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CluQ06890 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CluQ06890 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CluQ06890 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CluQ06890 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CluQ06890 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CluQ06890 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CluQ06890 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CluQ06890 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CluQ06890 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CluQ06890 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CluQ06890 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CluQ06890 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CluQ06890 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CluQ06890 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CluQ06890 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CluQ06890 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CluQ06890 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CluQ06890 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CluQ06890 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CluQ06890 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CluQ06890 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CluQ06890 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CluQ06890 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CluQ06890 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CluQ06890 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CluQ06890 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CluQ06890 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CluQ06890 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CluQ06890 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CluQ06890 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CluQ06890 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CluQ06890 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CluQ06890 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CluQ06890 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CluQ06890 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CluQ06890 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CluQ06890 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CluQ06890 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CluQ06890 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CluQ06890 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CluQ06890 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CluQ06890 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CluQ06890 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CluQ06890 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CluQ06890 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CluQ06890 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CluQ06890 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CluQ06890 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CluQ06890 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CluQ06890 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CluQ06890 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CluQ06890 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CluQ06890 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CluQ06890 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CluQ06890 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CluQ06890 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CluQ06890 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CluQ06890 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CluQ06890 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CluQ06890 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CluQ06890 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CluQ06890 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CluQ06890 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CluQ06890 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CluQ06890 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CluQ06890 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CluQ06890 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CluQ06890 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CluQ06890 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CluQ06890 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CluQ06890 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CluQ06890 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CluQ06890 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CluQ06890 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CluQ06890 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CluQ06890 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CluQ06890 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CluQ06890 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CluQ06890 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CluQ06890 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CluQ06890 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CluQ06890 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CluQ06890 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CluQ06890 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CluQ06890 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CluQ06890 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CluQ06890 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CluQ06890 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CluQ06890 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms