Protein–RNA interactions for Protein: Q06507

Atf4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf4Q06507 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atf4Q06507 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atf4Q06507 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atf4Q06507 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atf4Q06507 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atf4Q06507 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atf4Q06507 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atf4Q06507 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atf4Q06507 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atf4Q06507 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atf4Q06507 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atf4Q06507 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atf4Q06507 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atf4Q06507 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atf4Q06507 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atf4Q06507 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atf4Q06507 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atf4Q06507 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atf4Q06507 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atf4Q06507 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atf4Q06507 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atf4Q06507 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atf4Q06507 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atf4Q06507 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atf4Q06507 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atf4Q06507 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atf4Q06507 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atf4Q06507 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atf4Q06507 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atf4Q06507 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atf4Q06507 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atf4Q06507 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atf4Q06507 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atf4Q06507 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atf4Q06507 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atf4Q06507 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atf4Q06507 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atf4Q06507 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atf4Q06507 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atf4Q06507 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atf4Q06507 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atf4Q06507 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atf4Q06507 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Atf4Q06507 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atf4Q06507 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atf4Q06507 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atf4Q06507 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atf4Q06507 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atf4Q06507 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atf4Q06507 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atf4Q06507 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atf4Q06507 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atf4Q06507 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Atf4Q06507 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atf4Q06507 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Atf4Q06507 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atf4Q06507 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atf4Q06507 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atf4Q06507 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atf4Q06507 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atf4Q06507 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Atf4Q06507 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atf4Q06507 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atf4Q06507 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atf4Q06507 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Atf4Q06507 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atf4Q06507 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Atf4Q06507 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Atf4Q06507 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atf4Q06507 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atf4Q06507 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atf4Q06507 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atf4Q06507 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atf4Q06507 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atf4Q06507 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atf4Q06507 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atf4Q06507 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Atf4Q06507 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atf4Q06507 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atf4Q06507 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atf4Q06507 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atf4Q06507 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atf4Q06507 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atf4Q06507 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Atf4Q06507 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atf4Q06507 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Atf4Q06507 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atf4Q06507 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atf4Q06507 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atf4Q06507 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atf4Q06507 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atf4Q06507 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atf4Q06507 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atf4Q06507 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atf4Q06507 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atf4Q06507 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Atf4Q06507 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atf4Q06507 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atf4Q06507 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atf4Q06507 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.2 ms