Protein–RNA interactions for Protein: Q05793

Hspg2, Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspg2Q05793 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hspg2Q05793 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hspg2Q05793 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hspg2Q05793 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hspg2Q05793 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hspg2Q05793 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hspg2Q05793 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hspg2Q05793 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hspg2Q05793 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hspg2Q05793 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hspg2Q05793 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hspg2Q05793 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hspg2Q05793 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hspg2Q05793 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hspg2Q05793 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hspg2Q05793 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hspg2Q05793 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hspg2Q05793 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hspg2Q05793 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hspg2Q05793 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hspg2Q05793 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hspg2Q05793 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hspg2Q05793 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hspg2Q05793 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hspg2Q05793 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hspg2Q05793 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hspg2Q05793 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hspg2Q05793 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hspg2Q05793 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hspg2Q05793 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hspg2Q05793 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hspg2Q05793 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hspg2Q05793 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hspg2Q05793 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hspg2Q05793 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hspg2Q05793 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hspg2Q05793 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hspg2Q05793 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hspg2Q05793 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hspg2Q05793 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hspg2Q05793 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hspg2Q05793 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hspg2Q05793 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hspg2Q05793 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hspg2Q05793 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hspg2Q05793 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hspg2Q05793 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hspg2Q05793 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hspg2Q05793 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hspg2Q05793 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hspg2Q05793 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hspg2Q05793 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hspg2Q05793 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hspg2Q05793 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hspg2Q05793 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hspg2Q05793 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hspg2Q05793 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hspg2Q05793 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hspg2Q05793 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hspg2Q05793 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hspg2Q05793 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hspg2Q05793 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hspg2Q05793 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hspg2Q05793 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hspg2Q05793 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hspg2Q05793 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hspg2Q05793 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hspg2Q05793 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hspg2Q05793 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hspg2Q05793 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hspg2Q05793 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hspg2Q05793 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hspg2Q05793 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hspg2Q05793 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hspg2Q05793 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hspg2Q05793 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hspg2Q05793 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hspg2Q05793 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hspg2Q05793 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hspg2Q05793 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Hspg2Q05793 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hspg2Q05793 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hspg2Q05793 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hspg2Q05793 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hspg2Q05793 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hspg2Q05793 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hspg2Q05793 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hspg2Q05793 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hspg2Q05793 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hspg2Q05793 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hspg2Q05793 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hspg2Q05793 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hspg2Q05793 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hspg2Q05793 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hspg2Q05793 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hspg2Q05793 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hspg2Q05793 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hspg2Q05793 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hspg2Q05793 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hspg2Q05793 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms