Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sox8Q04886 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sox8Q04886 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sox8Q04886 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sox8Q04886 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sox8Q04886 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sox8Q04886 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sox8Q04886 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sox8Q04886 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sox8Q04886 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sox8Q04886 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sox8Q04886 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sox8Q04886 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Sox8Q04886 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sox8Q04886 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Sox8Q04886 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sox8Q04886 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Sox8Q04886 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sox8Q04886 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sox8Q04886 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sox8Q04886 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sox8Q04886 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sox8Q04886 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Sox8Q04886 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Sox8Q04886 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sox8Q04886 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sox8Q04886 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sox8Q04886 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Sox8Q04886 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sox8Q04886 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sox8Q04886 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sox8Q04886 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sox8Q04886 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sox8Q04886 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sox8Q04886 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sox8Q04886 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sox8Q04886 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sox8Q04886 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sox8Q04886 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sox8Q04886 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sox8Q04886 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sox8Q04886 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sox8Q04886 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sox8Q04886 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sox8Q04886 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sox8Q04886 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sox8Q04886 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sox8Q04886 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sox8Q04886 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sox8Q04886 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sox8Q04886 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sox8Q04886 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sox8Q04886 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sox8Q04886 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sox8Q04886 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sox8Q04886 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Sox8Q04886 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sox8Q04886 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sox8Q04886 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sox8Q04886 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sox8Q04886 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sox8Q04886 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sox8Q04886 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sox8Q04886 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sox8Q04886 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sox8Q04886 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sox8Q04886 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sox8Q04886 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sox8Q04886 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sox8Q04886 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sox8Q04886 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sox8Q04886 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sox8Q04886 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sox8Q04886 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sox8Q04886 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sox8Q04886 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sox8Q04886 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sox8Q04886 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sox8Q04886 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sox8Q04886 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sox8Q04886 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sox8Q04886 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Sox8Q04886 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sox8Q04886 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sox8Q04886 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sox8Q04886 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sox8Q04886 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sox8Q04886 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sox8Q04886 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sox8Q04886 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sox8Q04886 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sox8Q04886 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sox8Q04886 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sox8Q04886 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sox8Q04886 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sox8Q04886 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sox8Q04886 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Sox8Q04886 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sox8Q04886 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sox8Q04886 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms