Protein–RNA interactions for Protein: Q04735

Cdk16, Cyclin-dependent kinase 16, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk16Q04735 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdk16Q04735 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdk16Q04735 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdk16Q04735 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdk16Q04735 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdk16Q04735 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdk16Q04735 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdk16Q04735 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdk16Q04735 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdk16Q04735 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdk16Q04735 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdk16Q04735 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdk16Q04735 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdk16Q04735 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdk16Q04735 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdk16Q04735 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdk16Q04735 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdk16Q04735 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdk16Q04735 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdk16Q04735 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdk16Q04735 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Cdk16Q04735 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Cdk16Q04735 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdk16Q04735 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdk16Q04735 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdk16Q04735 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdk16Q04735 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdk16Q04735 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdk16Q04735 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdk16Q04735 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdk16Q04735 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdk16Q04735 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdk16Q04735 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdk16Q04735 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdk16Q04735 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdk16Q04735 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdk16Q04735 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdk16Q04735 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdk16Q04735 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdk16Q04735 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdk16Q04735 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdk16Q04735 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdk16Q04735 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdk16Q04735 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdk16Q04735 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdk16Q04735 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdk16Q04735 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdk16Q04735 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdk16Q04735 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdk16Q04735 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdk16Q04735 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdk16Q04735 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdk16Q04735 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdk16Q04735 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdk16Q04735 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdk16Q04735 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdk16Q04735 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdk16Q04735 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdk16Q04735 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdk16Q04735 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdk16Q04735 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdk16Q04735 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cdk16Q04735 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cdk16Q04735 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cdk16Q04735 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cdk16Q04735 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cdk16Q04735 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdk16Q04735 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdk16Q04735 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdk16Q04735 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdk16Q04735 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdk16Q04735 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdk16Q04735 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdk16Q04735 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdk16Q04735 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdk16Q04735 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdk16Q04735 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdk16Q04735 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdk16Q04735 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdk16Q04735 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdk16Q04735 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdk16Q04735 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdk16Q04735 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdk16Q04735 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdk16Q04735 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdk16Q04735 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdk16Q04735 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdk16Q04735 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdk16Q04735 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdk16Q04735 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdk16Q04735 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdk16Q04735 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdk16Q04735 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdk16Q04735 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdk16Q04735 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdk16Q04735 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdk16Q04735 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdk16Q04735 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdk16Q04735 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdk16Q04735 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms