Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smarcad1Q04692 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smarcad1Q04692 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smarcad1Q04692 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smarcad1Q04692 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smarcad1Q04692 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smarcad1Q04692 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smarcad1Q04692 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smarcad1Q04692 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smarcad1Q04692 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smarcad1Q04692 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Smarcad1Q04692 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smarcad1Q04692 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smarcad1Q04692 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smarcad1Q04692 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smarcad1Q04692 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Smarcad1Q04692 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smarcad1Q04692 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smarcad1Q04692 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smarcad1Q04692 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smarcad1Q04692 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smarcad1Q04692 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smarcad1Q04692 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smarcad1Q04692 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smarcad1Q04692 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smarcad1Q04692 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Smarcad1Q04692 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Smarcad1Q04692 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smarcad1Q04692 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smarcad1Q04692 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smarcad1Q04692 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smarcad1Q04692 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smarcad1Q04692 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smarcad1Q04692 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smarcad1Q04692 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smarcad1Q04692 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smarcad1Q04692 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smarcad1Q04692 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smarcad1Q04692 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smarcad1Q04692 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smarcad1Q04692 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smarcad1Q04692 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smarcad1Q04692 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smarcad1Q04692 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smarcad1Q04692 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smarcad1Q04692 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smarcad1Q04692 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smarcad1Q04692 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smarcad1Q04692 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smarcad1Q04692 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smarcad1Q04692 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smarcad1Q04692 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smarcad1Q04692 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smarcad1Q04692 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smarcad1Q04692 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smarcad1Q04692 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smarcad1Q04692 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smarcad1Q04692 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smarcad1Q04692 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smarcad1Q04692 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smarcad1Q04692 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smarcad1Q04692 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Smarcad1Q04692 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smarcad1Q04692 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smarcad1Q04692 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smarcad1Q04692 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smarcad1Q04692 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smarcad1Q04692 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smarcad1Q04692 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smarcad1Q04692 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smarcad1Q04692 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smarcad1Q04692 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Smarcad1Q04692 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Smarcad1Q04692 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smarcad1Q04692 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smarcad1Q04692 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Smarcad1Q04692 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Smarcad1Q04692 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Smarcad1Q04692 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smarcad1Q04692 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarcad1Q04692 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarcad1Q04692 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarcad1Q04692 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarcad1Q04692 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarcad1Q04692 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarcad1Q04692 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarcad1Q04692 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarcad1Q04692 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarcad1Q04692 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarcad1Q04692 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarcad1Q04692 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarcad1Q04692 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarcad1Q04692 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarcad1Q04692 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smarcad1Q04692 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smarcad1Q04692 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smarcad1Q04692 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smarcad1Q04692 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smarcad1Q04692 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smarcad1Q04692 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms