Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nf1Q04690 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nf1Q04690 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nf1Q04690 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nf1Q04690 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nf1Q04690 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nf1Q04690 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nf1Q04690 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nf1Q04690 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nf1Q04690 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Nf1Q04690 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nf1Q04690 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Nf1Q04690 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nf1Q04690 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nf1Q04690 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nf1Q04690 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nf1Q04690 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nf1Q04690 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nf1Q04690 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nf1Q04690 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nf1Q04690 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nf1Q04690 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nf1Q04690 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nf1Q04690 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nf1Q04690 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nf1Q04690 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nf1Q04690 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nf1Q04690 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nf1Q04690 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nf1Q04690 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nf1Q04690 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nf1Q04690 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nf1Q04690 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nf1Q04690 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nf1Q04690 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nf1Q04690 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nf1Q04690 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nf1Q04690 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nf1Q04690 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nf1Q04690 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nf1Q04690 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nf1Q04690 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nf1Q04690 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nf1Q04690 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nf1Q04690 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nf1Q04690 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nf1Q04690 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nf1Q04690 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nf1Q04690 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nf1Q04690 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nf1Q04690 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nf1Q04690 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nf1Q04690 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nf1Q04690 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nf1Q04690 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nf1Q04690 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nf1Q04690 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nf1Q04690 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nf1Q04690 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nf1Q04690 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nf1Q04690 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nf1Q04690 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nf1Q04690 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nf1Q04690 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nf1Q04690 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nf1Q04690 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Nf1Q04690 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nf1Q04690 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nf1Q04690 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nf1Q04690 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nf1Q04690 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nf1Q04690 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nf1Q04690 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nf1Q04690 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nf1Q04690 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nf1Q04690 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nf1Q04690 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nf1Q04690 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nf1Q04690 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nf1Q04690 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Nf1Q04690 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Nf1Q04690 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nf1Q04690 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nf1Q04690 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nf1Q04690 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nf1Q04690 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nf1Q04690 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nf1Q04690 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nf1Q04690 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nf1Q04690 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nf1Q04690 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nf1Q04690 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nf1Q04690 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nf1Q04690 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nf1Q04690 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nf1Q04690 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nf1Q04690 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nf1Q04690 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nf1Q04690 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nf1Q04690 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms