Protein–RNA interactions for Protein: Q03719

Kcnd1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnd1Q03719 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kcnd1Q03719 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kcnd1Q03719 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kcnd1Q03719 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kcnd1Q03719 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kcnd1Q03719 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kcnd1Q03719 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kcnd1Q03719 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kcnd1Q03719 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Kcnd1Q03719 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kcnd1Q03719 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Kcnd1Q03719 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kcnd1Q03719 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kcnd1Q03719 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kcnd1Q03719 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kcnd1Q03719 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kcnd1Q03719 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kcnd1Q03719 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kcnd1Q03719 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kcnd1Q03719 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kcnd1Q03719 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kcnd1Q03719 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kcnd1Q03719 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Kcnd1Q03719 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kcnd1Q03719 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kcnd1Q03719 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kcnd1Q03719 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kcnd1Q03719 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kcnd1Q03719 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kcnd1Q03719 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kcnd1Q03719 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kcnd1Q03719 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kcnd1Q03719 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kcnd1Q03719 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kcnd1Q03719 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kcnd1Q03719 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kcnd1Q03719 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kcnd1Q03719 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kcnd1Q03719 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kcnd1Q03719 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kcnd1Q03719 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kcnd1Q03719 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kcnd1Q03719 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Kcnd1Q03719 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kcnd1Q03719 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kcnd1Q03719 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kcnd1Q03719 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kcnd1Q03719 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kcnd1Q03719 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kcnd1Q03719 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kcnd1Q03719 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kcnd1Q03719 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Kcnd1Q03719 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kcnd1Q03719 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Kcnd1Q03719 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kcnd1Q03719 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Kcnd1Q03719 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kcnd1Q03719 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kcnd1Q03719 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kcnd1Q03719 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kcnd1Q03719 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kcnd1Q03719 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Kcnd1Q03719 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kcnd1Q03719 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kcnd1Q03719 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kcnd1Q03719 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kcnd1Q03719 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kcnd1Q03719 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kcnd1Q03719 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kcnd1Q03719 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kcnd1Q03719 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kcnd1Q03719 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kcnd1Q03719 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kcnd1Q03719 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kcnd1Q03719 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kcnd1Q03719 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kcnd1Q03719 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kcnd1Q03719 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kcnd1Q03719 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kcnd1Q03719 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Kcnd1Q03719 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kcnd1Q03719 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Kcnd1Q03719 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kcnd1Q03719 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kcnd1Q03719 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kcnd1Q03719 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kcnd1Q03719 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kcnd1Q03719 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kcnd1Q03719 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kcnd1Q03719 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kcnd1Q03719 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kcnd1Q03719 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kcnd1Q03719 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kcnd1Q03719 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kcnd1Q03719 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kcnd1Q03719 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kcnd1Q03719 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kcnd1Q03719 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kcnd1Q03719 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kcnd1Q03719 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms