Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nhlh1Q02576 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nhlh1Q02576 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nhlh1Q02576 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nhlh1Q02576 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nhlh1Q02576 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nhlh1Q02576 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nhlh1Q02576 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nhlh1Q02576 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nhlh1Q02576 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nhlh1Q02576 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nhlh1Q02576 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nhlh1Q02576 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nhlh1Q02576 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nhlh1Q02576 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nhlh1Q02576 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nhlh1Q02576 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nhlh1Q02576 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nhlh1Q02576 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nhlh1Q02576 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nhlh1Q02576 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nhlh1Q02576 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nhlh1Q02576 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nhlh1Q02576 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nhlh1Q02576 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nhlh1Q02576 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nhlh1Q02576 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nhlh1Q02576 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nhlh1Q02576 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nhlh1Q02576 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nhlh1Q02576 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nhlh1Q02576 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nhlh1Q02576 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nhlh1Q02576 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nhlh1Q02576 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Nhlh1Q02576 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nhlh1Q02576 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nhlh1Q02576 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nhlh1Q02576 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nhlh1Q02576 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nhlh1Q02576 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nhlh1Q02576 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nhlh1Q02576 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Nhlh1Q02576 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nhlh1Q02576 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nhlh1Q02576 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nhlh1Q02576 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nhlh1Q02576 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nhlh1Q02576 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nhlh1Q02576 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nhlh1Q02576 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nhlh1Q02576 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Nhlh1Q02576 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nhlh1Q02576 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nhlh1Q02576 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nhlh1Q02576 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nhlh1Q02576 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nhlh1Q02576 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nhlh1Q02576 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nhlh1Q02576 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nhlh1Q02576 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nhlh1Q02576 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nhlh1Q02576 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nhlh1Q02576 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nhlh1Q02576 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nhlh1Q02576 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nhlh1Q02576 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nhlh1Q02576 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nhlh1Q02576 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Nhlh1Q02576 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Nhlh1Q02576 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nhlh1Q02576 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nhlh1Q02576 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nhlh1Q02576 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nhlh1Q02576 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nhlh1Q02576 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nhlh1Q02576 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nhlh1Q02576 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nhlh1Q02576 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Nhlh1Q02576 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nhlh1Q02576 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nhlh1Q02576 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Nhlh1Q02576 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nhlh1Q02576 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nhlh1Q02576 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nhlh1Q02576 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nhlh1Q02576 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nhlh1Q02576 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nhlh1Q02576 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nhlh1Q02576 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nhlh1Q02576 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nhlh1Q02576 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nhlh1Q02576 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nhlh1Q02576 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nhlh1Q02576 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nhlh1Q02576 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nhlh1Q02576 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nhlh1Q02576 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nhlh1Q02576 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nhlh1Q02576 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms