Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctnnb1Q02248 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctnnb1Q02248 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctnnb1Q02248 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctnnb1Q02248 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctnnb1Q02248 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctnnb1Q02248 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctnnb1Q02248 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctnnb1Q02248 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctnnb1Q02248 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctnnb1Q02248 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctnnb1Q02248 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctnnb1Q02248 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctnnb1Q02248 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctnnb1Q02248 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctnnb1Q02248 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctnnb1Q02248 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctnnb1Q02248 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctnnb1Q02248 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctnnb1Q02248 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctnnb1Q02248 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctnnb1Q02248 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctnnb1Q02248 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctnnb1Q02248 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctnnb1Q02248 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctnnb1Q02248 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctnnb1Q02248 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctnnb1Q02248 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctnnb1Q02248 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctnnb1Q02248 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ctnnb1Q02248 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ctnnb1Q02248 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ctnnb1Q02248 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctnnb1Q02248 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctnnb1Q02248 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctnnb1Q02248 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctnnb1Q02248 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctnnb1Q02248 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctnnb1Q02248 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctnnb1Q02248 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctnnb1Q02248 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ctnnb1Q02248 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ctnnb1Q02248 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ctnnb1Q02248 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ctnnb1Q02248 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ctnnb1Q02248 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ctnnb1Q02248 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctnnb1Q02248 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctnnb1Q02248 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctnnb1Q02248 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctnnb1Q02248 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ctnnb1Q02248 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ctnnb1Q02248 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ctnnb1Q02248 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ctnnb1Q02248 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ctnnb1Q02248 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ctnnb1Q02248 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ctnnb1Q02248 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ctnnb1Q02248 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ctnnb1Q02248 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ctnnb1Q02248 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ctnnb1Q02248 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ctnnb1Q02248 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ctnnb1Q02248 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ctnnb1Q02248 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ctnnb1Q02248 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctnnb1Q02248 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctnnb1Q02248 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctnnb1Q02248 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctnnb1Q02248 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctnnb1Q02248 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctnnb1Q02248 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctnnb1Q02248 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctnnb1Q02248 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctnnb1Q02248 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctnnb1Q02248 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctnnb1Q02248 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctnnb1Q02248 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctnnb1Q02248 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctnnb1Q02248 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctnnb1Q02248 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctnnb1Q02248 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctnnb1Q02248 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctnnb1Q02248 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctnnb1Q02248 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctnnb1Q02248 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctnnb1Q02248 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctnnb1Q02248 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctnnb1Q02248 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctnnb1Q02248 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctnnb1Q02248 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctnnb1Q02248 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctnnb1Q02248 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctnnb1Q02248 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctnnb1Q02248 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctnnb1Q02248 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctnnb1Q02248 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctnnb1Q02248 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctnnb1Q02248 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctnnb1Q02248 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms