Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrkcqQ02111 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrkcqQ02111 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrkcqQ02111 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrkcqQ02111 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PrkcqQ02111 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrkcqQ02111 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrkcqQ02111 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PrkcqQ02111 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PrkcqQ02111 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrkcqQ02111 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrkcqQ02111 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrkcqQ02111 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrkcqQ02111 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PrkcqQ02111 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PrkcqQ02111 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PrkcqQ02111 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PrkcqQ02111 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PrkcqQ02111 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PrkcqQ02111 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PrkcqQ02111 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PrkcqQ02111 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PrkcqQ02111 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PrkcqQ02111 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PrkcqQ02111 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrkcqQ02111 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrkcqQ02111 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrkcqQ02111 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrkcqQ02111 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrkcqQ02111 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrkcqQ02111 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrkcqQ02111 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrkcqQ02111 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrkcqQ02111 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrkcqQ02111 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrkcqQ02111 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrkcqQ02111 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrkcqQ02111 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrkcqQ02111 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PrkcqQ02111 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrkcqQ02111 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrkcqQ02111 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrkcqQ02111 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrkcqQ02111 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrkcqQ02111 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrkcqQ02111 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrkcqQ02111 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PrkcqQ02111 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrkcqQ02111 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrkcqQ02111 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrkcqQ02111 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrkcqQ02111 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PrkcqQ02111 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrkcqQ02111 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrkcqQ02111 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrkcqQ02111 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrkcqQ02111 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrkcqQ02111 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrkcqQ02111 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PrkcqQ02111 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PrkcqQ02111 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PrkcqQ02111 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PrkcqQ02111 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PrkcqQ02111 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PrkcqQ02111 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PrkcqQ02111 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PrkcqQ02111 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PrkcqQ02111 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PrkcqQ02111 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PrkcqQ02111 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PrkcqQ02111 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PrkcqQ02111 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PrkcqQ02111 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrkcqQ02111 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrkcqQ02111 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrkcqQ02111 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrkcqQ02111 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrkcqQ02111 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrkcqQ02111 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrkcqQ02111 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrkcqQ02111 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrkcqQ02111 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrkcqQ02111 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrkcqQ02111 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrkcqQ02111 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrkcqQ02111 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PrkcqQ02111 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrkcqQ02111 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrkcqQ02111 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrkcqQ02111 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrkcqQ02111 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrkcqQ02111 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrkcqQ02111 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrkcqQ02111 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrkcqQ02111 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrkcqQ02111 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PrkcqQ02111 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PrkcqQ02111 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PrkcqQ02111 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PrkcqQ02111 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms