Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RykQ01887 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RykQ01887 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RykQ01887 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RykQ01887 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RykQ01887 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.78
RykQ01887 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RykQ01887 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RykQ01887 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RykQ01887 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RykQ01887 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RykQ01887 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RykQ01887 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RykQ01887 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RykQ01887 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RykQ01887 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RykQ01887 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RykQ01887 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RykQ01887 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RykQ01887 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RykQ01887 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RykQ01887 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RykQ01887 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RykQ01887 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RykQ01887 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RykQ01887 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RykQ01887 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RykQ01887 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RykQ01887 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RykQ01887 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
RykQ01887 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RykQ01887 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RykQ01887 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RykQ01887 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RykQ01887 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RykQ01887 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RykQ01887 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RykQ01887 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RykQ01887 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RykQ01887 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RykQ01887 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RykQ01887 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RykQ01887 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RykQ01887 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RykQ01887 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
RykQ01887 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RykQ01887 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RykQ01887 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RykQ01887 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RykQ01887 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RykQ01887 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RykQ01887 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RykQ01887 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RykQ01887 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RykQ01887 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RykQ01887 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RykQ01887 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RykQ01887 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RykQ01887 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RykQ01887 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RykQ01887 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RykQ01887 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RykQ01887 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RykQ01887 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RykQ01887 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RykQ01887 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RykQ01887 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
RykQ01887 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RykQ01887 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RykQ01887 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RykQ01887 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RykQ01887 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RykQ01887 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RykQ01887 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RykQ01887 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RykQ01887 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RykQ01887 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RykQ01887 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RykQ01887 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RykQ01887 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RykQ01887 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
RykQ01887 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RykQ01887 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RykQ01887 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RykQ01887 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RykQ01887 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RykQ01887 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RykQ01887 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RykQ01887 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RykQ01887 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RykQ01887 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RykQ01887 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RykQ01887 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RykQ01887 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RykQ01887 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RykQ01887 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RykQ01887 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RykQ01887 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RykQ01887 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RykQ01887 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms