Protein–RNA interactions for Protein: P99025

Gchfr, GTP cyclohydrolase 1 feedback regulatory protein, mousemouse

Predictions only

Length 84 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GchfrP99025 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GchfrP99025 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GchfrP99025 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GchfrP99025 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GchfrP99025 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GchfrP99025 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GchfrP99025 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GchfrP99025 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
GchfrP99025 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GchfrP99025 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GchfrP99025 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GchfrP99025 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GchfrP99025 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GchfrP99025 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GchfrP99025 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GchfrP99025 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GchfrP99025 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GchfrP99025 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GchfrP99025 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GchfrP99025 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GchfrP99025 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GchfrP99025 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GchfrP99025 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GchfrP99025 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GchfrP99025 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GchfrP99025 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GchfrP99025 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GchfrP99025 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GchfrP99025 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GchfrP99025 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GchfrP99025 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GchfrP99025 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GchfrP99025 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GchfrP99025 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GchfrP99025 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GchfrP99025 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GchfrP99025 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GchfrP99025 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GchfrP99025 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GchfrP99025 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GchfrP99025 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GchfrP99025 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GchfrP99025 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GchfrP99025 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GchfrP99025 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GchfrP99025 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GchfrP99025 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GchfrP99025 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GchfrP99025 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GchfrP99025 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GchfrP99025 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GchfrP99025 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GchfrP99025 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GchfrP99025 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GchfrP99025 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GchfrP99025 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GchfrP99025 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GchfrP99025 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GchfrP99025 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GchfrP99025 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GchfrP99025 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GchfrP99025 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GchfrP99025 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GchfrP99025 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GchfrP99025 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
GchfrP99025 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GchfrP99025 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GchfrP99025 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GchfrP99025 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GchfrP99025 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GchfrP99025 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GchfrP99025 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GchfrP99025 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GchfrP99025 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GchfrP99025 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GchfrP99025 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GchfrP99025 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GchfrP99025 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GchfrP99025 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GchfrP99025 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GchfrP99025 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GchfrP99025 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GchfrP99025 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GchfrP99025 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GchfrP99025 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GchfrP99025 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GchfrP99025 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GchfrP99025 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GchfrP99025 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GchfrP99025 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GchfrP99025 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GchfrP99025 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GchfrP99025 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GchfrP99025 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GchfrP99025 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GchfrP99025 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GchfrP99025 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GchfrP99025 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GchfrP99025 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GchfrP99025 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms