Protein–RNA interactions for Protein: P97873

Loxl1, Lysyl oxidase homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Loxl1P97873 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Loxl1P97873 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Loxl1P97873 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Loxl1P97873 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Loxl1P97873 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Loxl1P97873 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Loxl1P97873 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Loxl1P97873 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Loxl1P97873 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Loxl1P97873 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Loxl1P97873 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Loxl1P97873 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Loxl1P97873 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Loxl1P97873 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Loxl1P97873 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Loxl1P97873 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Loxl1P97873 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Loxl1P97873 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Loxl1P97873 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Loxl1P97873 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Loxl1P97873 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Loxl1P97873 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Loxl1P97873 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Loxl1P97873 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Loxl1P97873 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Loxl1P97873 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Loxl1P97873 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Loxl1P97873 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Loxl1P97873 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Loxl1P97873 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Loxl1P97873 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Loxl1P97873 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Loxl1P97873 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Loxl1P97873 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Loxl1P97873 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Loxl1P97873 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Loxl1P97873 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Loxl1P97873 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Loxl1P97873 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Loxl1P97873 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Loxl1P97873 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Loxl1P97873 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Loxl1P97873 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Loxl1P97873 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Loxl1P97873 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Loxl1P97873 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Loxl1P97873 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Loxl1P97873 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Loxl1P97873 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Loxl1P97873 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Loxl1P97873 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Loxl1P97873 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Loxl1P97873 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Loxl1P97873 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Loxl1P97873 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Loxl1P97873 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Loxl1P97873 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Loxl1P97873 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Loxl1P97873 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Loxl1P97873 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Loxl1P97873 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Loxl1P97873 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Loxl1P97873 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Loxl1P97873 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Loxl1P97873 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Loxl1P97873 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Loxl1P97873 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Loxl1P97873 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Loxl1P97873 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Loxl1P97873 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Loxl1P97873 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Loxl1P97873 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Loxl1P97873 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Loxl1P97873 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Loxl1P97873 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Loxl1P97873 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Loxl1P97873 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Loxl1P97873 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Loxl1P97873 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Loxl1P97873 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Loxl1P97873 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Loxl1P97873 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Loxl1P97873 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Loxl1P97873 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Loxl1P97873 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Loxl1P97873 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Loxl1P97873 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Loxl1P97873 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Loxl1P97873 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Loxl1P97873 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Loxl1P97873 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Loxl1P97873 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Loxl1P97873 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Loxl1P97873 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Loxl1P97873 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Loxl1P97873 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Loxl1P97873 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Loxl1P97873 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Loxl1P97873 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Loxl1P97873 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms