Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Smarcc1P97496 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Smarcc1P97496 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Smarcc1P97496 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Smarcc1P97496 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Smarcc1P97496 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Smarcc1P97496 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Smarcc1P97496 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Smarcc1P97496 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Smarcc1P97496 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Smarcc1P97496 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Smarcc1P97496 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Smarcc1P97496 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Smarcc1P97496 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Smarcc1P97496 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Smarcc1P97496 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Smarcc1P97496 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Smarcc1P97496 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Smarcc1P97496 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Smarcc1P97496 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Smarcc1P97496 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Smarcc1P97496 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Smarcc1P97496 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Smarcc1P97496 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Smarcc1P97496 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Smarcc1P97496 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Smarcc1P97496 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Smarcc1P97496 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Smarcc1P97496 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Smarcc1P97496 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Smarcc1P97496 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Smarcc1P97496 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Smarcc1P97496 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Smarcc1P97496 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Smarcc1P97496 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Smarcc1P97496 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Smarcc1P97496 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Smarcc1P97496 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Smarcc1P97496 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Smarcc1P97496 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Smarcc1P97496 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Smarcc1P97496 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Smarcc1P97496 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Smarcc1P97496 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Smarcc1P97496 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Smarcc1P97496 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Smarcc1P97496 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Smarcc1P97496 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Smarcc1P97496 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Smarcc1P97496 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Smarcc1P97496 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Smarcc1P97496 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Smarcc1P97496 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Smarcc1P97496 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Smarcc1P97496 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Smarcc1P97496 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Smarcc1P97496 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Smarcc1P97496 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Smarcc1P97496 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Smarcc1P97496 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Smarcc1P97496 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Smarcc1P97496 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Smarcc1P97496 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Smarcc1P97496 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Smarcc1P97496 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Smarcc1P97496 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Smarcc1P97496 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Smarcc1P97496 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Smarcc1P97496 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Smarcc1P97496 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Smarcc1P97496 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Smarcc1P97496 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Smarcc1P97496 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Smarcc1P97496 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Smarcc1P97496 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Smarcc1P97496 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Smarcc1P97496 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Smarcc1P97496 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Smarcc1P97496 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Smarcc1P97496 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Smarcc1P97496 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Smarcc1P97496 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Smarcc1P97496 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Smarcc1P97496 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Smarcc1P97496 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Smarcc1P97496 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Smarcc1P97496 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Smarcc1P97496 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Smarcc1P97496 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Smarcc1P97496 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Smarcc1P97496 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Smarcc1P97496 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Smarcc1P97496 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Smarcc1P97496 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Smarcc1P97496 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Smarcc1P97496 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Smarcc1P97496 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Smarcc1P97496 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Smarcc1P97496 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Smarcc1P97496 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms