Protein–RNA interactions for Protein: P97471

Smad4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad4P97471 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smad4P97471 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smad4P97471 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smad4P97471 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smad4P97471 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Smad4P97471 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smad4P97471 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smad4P97471 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smad4P97471 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smad4P97471 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smad4P97471 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Smad4P97471 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smad4P97471 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smad4P97471 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smad4P97471 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smad4P97471 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smad4P97471 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smad4P97471 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smad4P97471 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smad4P97471 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smad4P97471 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smad4P97471 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smad4P97471 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smad4P97471 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smad4P97471 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smad4P97471 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smad4P97471 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smad4P97471 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smad4P97471 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smad4P97471 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Smad4P97471 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smad4P97471 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smad4P97471 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smad4P97471 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Smad4P97471 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smad4P97471 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smad4P97471 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smad4P97471 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smad4P97471 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smad4P97471 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smad4P97471 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smad4P97471 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smad4P97471 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smad4P97471 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smad4P97471 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smad4P97471 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smad4P97471 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smad4P97471 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smad4P97471 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smad4P97471 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smad4P97471 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Smad4P97471 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smad4P97471 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smad4P97471 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smad4P97471 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smad4P97471 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smad4P97471 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Smad4P97471 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smad4P97471 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smad4P97471 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smad4P97471 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smad4P97471 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smad4P97471 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smad4P97471 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smad4P97471 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smad4P97471 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smad4P97471 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smad4P97471 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Smad4P97471 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Smad4P97471 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smad4P97471 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smad4P97471 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smad4P97471 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smad4P97471 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smad4P97471 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smad4P97471 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smad4P97471 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smad4P97471 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smad4P97471 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smad4P97471 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smad4P97471 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Smad4P97471 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smad4P97471 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smad4P97471 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smad4P97471 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smad4P97471 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smad4P97471 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smad4P97471 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Smad4P97471 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smad4P97471 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smad4P97471 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smad4P97471 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smad4P97471 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smad4P97471 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smad4P97471 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smad4P97471 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smad4P97471 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smad4P97471 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smad4P97471 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smad4P97471 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
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