Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nbr1P97432 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nbr1P97432 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nbr1P97432 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nbr1P97432 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nbr1P97432 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nbr1P97432 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nbr1P97432 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nbr1P97432 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nbr1P97432 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nbr1P97432 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nbr1P97432 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nbr1P97432 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nbr1P97432 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nbr1P97432 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Nbr1P97432 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nbr1P97432 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nbr1P97432 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nbr1P97432 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nbr1P97432 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nbr1P97432 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nbr1P97432 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nbr1P97432 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nbr1P97432 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nbr1P97432 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nbr1P97432 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nbr1P97432 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nbr1P97432 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nbr1P97432 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nbr1P97432 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nbr1P97432 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Nbr1P97432 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Nbr1P97432 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nbr1P97432 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nbr1P97432 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nbr1P97432 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nbr1P97432 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nbr1P97432 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Nbr1P97432 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nbr1P97432 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nbr1P97432 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nbr1P97432 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nbr1P97432 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nbr1P97432 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nbr1P97432 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nbr1P97432 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nbr1P97432 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nbr1P97432 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nbr1P97432 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nbr1P97432 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nbr1P97432 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nbr1P97432 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nbr1P97432 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nbr1P97432 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nbr1P97432 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nbr1P97432 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nbr1P97432 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nbr1P97432 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Nbr1P97432 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nbr1P97432 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nbr1P97432 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nbr1P97432 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nbr1P97432 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nbr1P97432 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nbr1P97432 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nbr1P97432 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nbr1P97432 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nbr1P97432 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nbr1P97432 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Nbr1P97432 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nbr1P97432 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nbr1P97432 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nbr1P97432 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nbr1P97432 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nbr1P97432 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nbr1P97432 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nbr1P97432 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nbr1P97432 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nbr1P97432 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nbr1P97432 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nbr1P97432 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nbr1P97432 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nbr1P97432 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nbr1P97432 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nbr1P97432 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Nbr1P97432 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nbr1P97432 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nbr1P97432 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nbr1P97432 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nbr1P97432 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nbr1P97432 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nbr1P97432 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Nbr1P97432 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nbr1P97432 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nbr1P97432 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nbr1P97432 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nbr1P97432 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nbr1P97432 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nbr1P97432 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nbr1P97432 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms