Protein–RNA interactions for Protein: P97333

Nrp1, Neuropilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 923 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrp1P97333 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Nrp1P97333 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nrp1P97333 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nrp1P97333 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nrp1P97333 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nrp1P97333 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nrp1P97333 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nrp1P97333 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Nrp1P97333 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nrp1P97333 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nrp1P97333 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nrp1P97333 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nrp1P97333 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nrp1P97333 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nrp1P97333 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nrp1P97333 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nrp1P97333 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nrp1P97333 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nrp1P97333 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nrp1P97333 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nrp1P97333 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nrp1P97333 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nrp1P97333 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Nrp1P97333 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nrp1P97333 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nrp1P97333 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nrp1P97333 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nrp1P97333 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nrp1P97333 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nrp1P97333 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Nrp1P97333 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nrp1P97333 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nrp1P97333 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nrp1P97333 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nrp1P97333 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nrp1P97333 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nrp1P97333 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nrp1P97333 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nrp1P97333 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nrp1P97333 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nrp1P97333 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nrp1P97333 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nrp1P97333 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nrp1P97333 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nrp1P97333 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nrp1P97333 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Nrp1P97333 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nrp1P97333 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Nrp1P97333 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nrp1P97333 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nrp1P97333 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nrp1P97333 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nrp1P97333 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nrp1P97333 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nrp1P97333 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nrp1P97333 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nrp1P97333 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nrp1P97333 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Nrp1P97333 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nrp1P97333 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nrp1P97333 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nrp1P97333 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nrp1P97333 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nrp1P97333 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nrp1P97333 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nrp1P97333 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nrp1P97333 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nrp1P97333 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nrp1P97333 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nrp1P97333 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nrp1P97333 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nrp1P97333 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nrp1P97333 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nrp1P97333 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nrp1P97333 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nrp1P97333 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nrp1P97333 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nrp1P97333 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nrp1P97333 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nrp1P97333 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nrp1P97333 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nrp1P97333 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nrp1P97333 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nrp1P97333 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nrp1P97333 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nrp1P97333 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nrp1P97333 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nrp1P97333 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Nrp1P97333 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nrp1P97333 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nrp1P97333 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nrp1P97333 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nrp1P97333 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nrp1P97333 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Nrp1P97333 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nrp1P97333 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nrp1P97333 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nrp1P97333 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nrp1P97333 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nrp1P97333 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms